Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SGIP1Q9BQI5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SGIP1Q9BQI5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SGIP1Q9BQI5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SGIP1Q9BQI5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SGIP1Q9BQI5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SGIP1Q9BQI5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SGIP1Q9BQI5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SGIP1Q9BQI5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SGIP1Q9BQI5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
SGIP1Q9BQI5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
SGIP1Q9BQI5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SGIP1Q9BQI5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SGIP1Q9BQI5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SGIP1Q9BQI5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SGIP1Q9BQI5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SGIP1Q9BQI5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
SGIP1Q9BQI5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
SGIP1Q9BQI5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SGIP1Q9BQI5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SGIP1Q9BQI5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SGIP1Q9BQI5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SGIP1Q9BQI5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SGIP1Q9BQI5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SGIP1Q9BQI5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SGIP1Q9BQI5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SGIP1Q9BQI5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SGIP1Q9BQI5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SGIP1Q9BQI5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SGIP1Q9BQI5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SGIP1Q9BQI5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SGIP1Q9BQI5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SGIP1Q9BQI5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SGIP1Q9BQI5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SGIP1Q9BQI5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SGIP1Q9BQI5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SGIP1Q9BQI5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SGIP1Q9BQI5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SGIP1Q9BQI5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SGIP1Q9BQI5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SGIP1Q9BQI5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SGIP1Q9BQI5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SGIP1Q9BQI5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SGIP1Q9BQI5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SGIP1Q9BQI5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SGIP1Q9BQI5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SGIP1Q9BQI5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
SGIP1Q9BQI5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
SGIP1Q9BQI5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SGIP1Q9BQI5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SGIP1Q9BQI5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SGIP1Q9BQI5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SGIP1Q9BQI5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SGIP1Q9BQI5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SGIP1Q9BQI5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SGIP1Q9BQI5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SGIP1Q9BQI5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SGIP1Q9BQI5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SGIP1Q9BQI5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SGIP1Q9BQI5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SGIP1Q9BQI5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
SGIP1Q9BQI5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SGIP1Q9BQI5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SGIP1Q9BQI5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SGIP1Q9BQI5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SGIP1Q9BQI5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
SGIP1Q9BQI5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SGIP1Q9BQI5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SGIP1Q9BQI5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SGIP1Q9BQI5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SGIP1Q9BQI5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SGIP1Q9BQI5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SGIP1Q9BQI5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
SGIP1Q9BQI5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SGIP1Q9BQI5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SGIP1Q9BQI5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SGIP1Q9BQI5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SGIP1Q9BQI5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SGIP1Q9BQI5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SGIP1Q9BQI5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SGIP1Q9BQI5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SGIP1Q9BQI5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SGIP1Q9BQI5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SGIP1Q9BQI5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SGIP1Q9BQI5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SGIP1Q9BQI5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SGIP1Q9BQI5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SGIP1Q9BQI5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SGIP1Q9BQI5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SGIP1Q9BQI5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SGIP1Q9BQI5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SGIP1Q9BQI5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SGIP1Q9BQI5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SGIP1Q9BQI5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SGIP1Q9BQI5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SGIP1Q9BQI5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SGIP1Q9BQI5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
SGIP1Q9BQI5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SGIP1Q9BQI5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SGIP1Q9BQI5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms