Protein–RNA interactions for Protein: Q99728

BARD1, BRCA1-associated RING domain protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARD1Q99728 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BARD1Q99728 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BARD1Q99728 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BARD1Q99728 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BARD1Q99728 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BARD1Q99728 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BARD1Q99728 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BARD1Q99728 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BARD1Q99728 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BARD1Q99728 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BARD1Q99728 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BARD1Q99728 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BARD1Q99728 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BARD1Q99728 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BARD1Q99728 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BARD1Q99728 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BARD1Q99728 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BARD1Q99728 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BARD1Q99728 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BARD1Q99728 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BARD1Q99728 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BARD1Q99728 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARD1Q99728 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARD1Q99728 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARD1Q99728 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BARD1Q99728 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BARD1Q99728 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BARD1Q99728 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BARD1Q99728 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BARD1Q99728 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BARD1Q99728 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BARD1Q99728 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BARD1Q99728 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BARD1Q99728 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BARD1Q99728 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BARD1Q99728 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BARD1Q99728 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BARD1Q99728 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BARD1Q99728 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BARD1Q99728 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BARD1Q99728 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BARD1Q99728 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BARD1Q99728 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BARD1Q99728 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BARD1Q99728 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BARD1Q99728 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BARD1Q99728 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BARD1Q99728 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BARD1Q99728 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BARD1Q99728 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BARD1Q99728 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BARD1Q99728 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BARD1Q99728 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BARD1Q99728 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BARD1Q99728 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BARD1Q99728 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BARD1Q99728 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BARD1Q99728 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BARD1Q99728 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BARD1Q99728 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BARD1Q99728 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BARD1Q99728 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BARD1Q99728 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BARD1Q99728 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BARD1Q99728 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BARD1Q99728 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BARD1Q99728 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BARD1Q99728 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BARD1Q99728 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BARD1Q99728 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BARD1Q99728 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BARD1Q99728 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BARD1Q99728 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BARD1Q99728 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BARD1Q99728 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BARD1Q99728 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BARD1Q99728 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BARD1Q99728 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BARD1Q99728 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BARD1Q99728 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BARD1Q99728 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BARD1Q99728 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BARD1Q99728 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BARD1Q99728 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BARD1Q99728 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BARD1Q99728 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BARD1Q99728 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BARD1Q99728 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BARD1Q99728 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BARD1Q99728 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BARD1Q99728 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BARD1Q99728 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BARD1Q99728 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BARD1Q99728 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BARD1Q99728 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BARD1Q99728 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BARD1Q99728 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BARD1Q99728 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BARD1Q99728 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BARD1Q99728 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms