Protein–RNA interactions for Protein: Q99727

TIMP4, Metalloproteinase inhibitor 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP4Q99727 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIMP4Q99727 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIMP4Q99727 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TIMP4Q99727 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TIMP4Q99727 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TIMP4Q99727 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TIMP4Q99727 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TIMP4Q99727 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TIMP4Q99727 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TIMP4Q99727 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TIMP4Q99727 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TIMP4Q99727 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TIMP4Q99727 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIMP4Q99727 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIMP4Q99727 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIMP4Q99727 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIMP4Q99727 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIMP4Q99727 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIMP4Q99727 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIMP4Q99727 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIMP4Q99727 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIMP4Q99727 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIMP4Q99727 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIMP4Q99727 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIMP4Q99727 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIMP4Q99727 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIMP4Q99727 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIMP4Q99727 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIMP4Q99727 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIMP4Q99727 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIMP4Q99727 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIMP4Q99727 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TIMP4Q99727 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TIMP4Q99727 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TIMP4Q99727 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TIMP4Q99727 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TIMP4Q99727 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TIMP4Q99727 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TIMP4Q99727 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TIMP4Q99727 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TIMP4Q99727 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TIMP4Q99727 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TIMP4Q99727 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TIMP4Q99727 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TIMP4Q99727 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TIMP4Q99727 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TIMP4Q99727 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TIMP4Q99727 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TIMP4Q99727 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TIMP4Q99727 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TIMP4Q99727 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TIMP4Q99727 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TIMP4Q99727 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TIMP4Q99727 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
TIMP4Q99727 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TIMP4Q99727 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TIMP4Q99727 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TIMP4Q99727 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TIMP4Q99727 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TIMP4Q99727 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TIMP4Q99727 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TIMP4Q99727 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TIMP4Q99727 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TIMP4Q99727 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TIMP4Q99727 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TIMP4Q99727 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TIMP4Q99727 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TIMP4Q99727 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TIMP4Q99727 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TIMP4Q99727 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TIMP4Q99727 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TIMP4Q99727 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TIMP4Q99727 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TIMP4Q99727 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TIMP4Q99727 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TIMP4Q99727 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TIMP4Q99727 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TIMP4Q99727 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TIMP4Q99727 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TIMP4Q99727 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TIMP4Q99727 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMP4Q99727 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMP4Q99727 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TIMP4Q99727 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TIMP4Q99727 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TIMP4Q99727 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TIMP4Q99727 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TIMP4Q99727 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TIMP4Q99727 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TIMP4Q99727 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TIMP4Q99727 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TIMP4Q99727 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TIMP4Q99727 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TIMP4Q99727 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TIMP4Q99727 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TIMP4Q99727 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TIMP4Q99727 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TIMP4Q99727 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TIMP4Q99727 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TIMP4Q99727 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms