Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
ARAP1Q96P48 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
ARAP1Q96P48 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
ARAP1Q96P48 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
ARAP1Q96P48 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC43.28■■■■■ 4.52
ARAP1Q96P48 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
ARAP1Q96P48 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
ARAP1Q96P48 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
ARAP1Q96P48 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC43.25■■■■■ 4.51
ARAP1Q96P48 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
ARAP1Q96P48 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
ARAP1Q96P48 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
ARAP1Q96P48 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
ARAP1Q96P48 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
ARAP1Q96P48 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC43.23■■■■■ 4.51
ARAP1Q96P48 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.23■■■■■ 4.51
ARAP1Q96P48 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC43.22■■■■■ 4.51
ARAP1Q96P48 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
ARAP1Q96P48 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC43.2■■■■■ 4.51
ARAP1Q96P48 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
ARAP1Q96P48 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
ARAP1Q96P48 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.51
ARAP1Q96P48 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
ARAP1Q96P48 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC43.18■■■■■ 4.5
ARAP1Q96P48 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC43.17■■■■■ 4.5
ARAP1Q96P48 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
ARAP1Q96P48 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
ARAP1Q96P48 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
ARAP1Q96P48 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
ARAP1Q96P48 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
ARAP1Q96P48 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.49
ARAP1Q96P48 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
ARAP1Q96P48 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.11■■■■■ 4.49
ARAP1Q96P48 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC43.1■■■■■ 4.49
ARAP1Q96P48 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC43.09■■■■■ 4.49
ARAP1Q96P48 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
ARAP1Q96P48 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC43.09■■■■■ 4.49
ARAP1Q96P48 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
ARAP1Q96P48 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC43.09■■■■■ 4.49
ARAP1Q96P48 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
ARAP1Q96P48 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
ARAP1Q96P48 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
ARAP1Q96P48 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
ARAP1Q96P48 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC43.05■■■■■ 4.48
ARAP1Q96P48 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
ARAP1Q96P48 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
ARAP1Q96P48 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
ARAP1Q96P48 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
ARAP1Q96P48 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
ARAP1Q96P48 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC42.96■■■■■ 4.47
ARAP1Q96P48 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
ARAP1Q96P48 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
ARAP1Q96P48 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.47
ARAP1Q96P48 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.47
ARAP1Q96P48 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
ARAP1Q96P48 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC42.93■■■■■ 4.46
ARAP1Q96P48 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC42.92■■■■■ 4.46
ARAP1Q96P48 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
ARAP1Q96P48 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC42.91■■■■■ 4.46
ARAP1Q96P48 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
ARAP1Q96P48 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
ARAP1Q96P48 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
ARAP1Q96P48 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.91■■■■■ 4.46
ARAP1Q96P48 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
ARAP1Q96P48 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
ARAP1Q96P48 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
ARAP1Q96P48 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC42.89■■■■■ 4.46
ARAP1Q96P48 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
ARAP1Q96P48 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
ARAP1Q96P48 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
ARAP1Q96P48 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
ARAP1Q96P48 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
ARAP1Q96P48 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
ARAP1Q96P48 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
ARAP1Q96P48 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
ARAP1Q96P48 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC42.83■■■■■ 4.45
ARAP1Q96P48 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
ARAP1Q96P48 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
ARAP1Q96P48 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC42.81■■■■■ 4.44
ARAP1Q96P48 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
ARAP1Q96P48 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
ARAP1Q96P48 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
ARAP1Q96P48 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
ARAP1Q96P48 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
ARAP1Q96P48 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC42.78■■■■■ 4.44
ARAP1Q96P48 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
ARAP1Q96P48 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC42.78■■■■■ 4.44
ARAP1Q96P48 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
ARAP1Q96P48 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.76■■■■■ 4.44
ARAP1Q96P48 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
ARAP1Q96P48 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
ARAP1Q96P48 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
ARAP1Q96P48 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC42.72■■■■■ 4.43
ARAP1Q96P48 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.72■■■■■ 4.43
ARAP1Q96P48 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
ARAP1Q96P48 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
ARAP1Q96P48 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
ARAP1Q96P48 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
ARAP1Q96P48 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
ARAP1Q96P48 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms