Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLIC6Q96NY7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLIC6Q96NY7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLIC6Q96NY7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CLIC6Q96NY7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLIC6Q96NY7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CLIC6Q96NY7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLIC6Q96NY7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLIC6Q96NY7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLIC6Q96NY7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLIC6Q96NY7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLIC6Q96NY7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLIC6Q96NY7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLIC6Q96NY7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLIC6Q96NY7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CLIC6Q96NY7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLIC6Q96NY7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLIC6Q96NY7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLIC6Q96NY7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLIC6Q96NY7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLIC6Q96NY7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLIC6Q96NY7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLIC6Q96NY7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLIC6Q96NY7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLIC6Q96NY7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLIC6Q96NY7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLIC6Q96NY7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLIC6Q96NY7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CLIC6Q96NY7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLIC6Q96NY7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLIC6Q96NY7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLIC6Q96NY7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CLIC6Q96NY7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLIC6Q96NY7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLIC6Q96NY7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLIC6Q96NY7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLIC6Q96NY7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CLIC6Q96NY7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLIC6Q96NY7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLIC6Q96NY7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLIC6Q96NY7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLIC6Q96NY7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLIC6Q96NY7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLIC6Q96NY7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLIC6Q96NY7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLIC6Q96NY7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLIC6Q96NY7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLIC6Q96NY7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLIC6Q96NY7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLIC6Q96NY7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLIC6Q96NY7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CLIC6Q96NY7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLIC6Q96NY7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLIC6Q96NY7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLIC6Q96NY7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLIC6Q96NY7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLIC6Q96NY7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLIC6Q96NY7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLIC6Q96NY7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLIC6Q96NY7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLIC6Q96NY7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLIC6Q96NY7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLIC6Q96NY7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLIC6Q96NY7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLIC6Q96NY7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLIC6Q96NY7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLIC6Q96NY7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLIC6Q96NY7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLIC6Q96NY7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CLIC6Q96NY7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLIC6Q96NY7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLIC6Q96NY7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLIC6Q96NY7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLIC6Q96NY7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLIC6Q96NY7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLIC6Q96NY7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLIC6Q96NY7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLIC6Q96NY7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLIC6Q96NY7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLIC6Q96NY7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLIC6Q96NY7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLIC6Q96NY7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLIC6Q96NY7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLIC6Q96NY7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CLIC6Q96NY7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLIC6Q96NY7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLIC6Q96NY7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLIC6Q96NY7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLIC6Q96NY7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLIC6Q96NY7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLIC6Q96NY7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLIC6Q96NY7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLIC6Q96NY7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLIC6Q96NY7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLIC6Q96NY7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLIC6Q96NY7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLIC6Q96NY7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CLIC6Q96NY7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLIC6Q96NY7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLIC6Q96NY7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms