Protein–RNA interactions for Protein: Q96N35

LINC00052, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00052, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00052Q96N35 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00052Q96N35 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00052Q96N35 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00052Q96N35 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00052Q96N35 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00052Q96N35 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LINC00052Q96N35 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00052Q96N35 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00052Q96N35 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00052Q96N35 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00052Q96N35 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00052Q96N35 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LINC00052Q96N35 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00052Q96N35 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00052Q96N35 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00052Q96N35 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00052Q96N35 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00052Q96N35 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00052Q96N35 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00052Q96N35 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00052Q96N35 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00052Q96N35 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00052Q96N35 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00052Q96N35 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00052Q96N35 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00052Q96N35 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00052Q96N35 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00052Q96N35 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00052Q96N35 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00052Q96N35 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00052Q96N35 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00052Q96N35 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00052Q96N35 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00052Q96N35 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00052Q96N35 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00052Q96N35 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00052Q96N35 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00052Q96N35 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00052Q96N35 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00052Q96N35 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00052Q96N35 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00052Q96N35 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00052Q96N35 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00052Q96N35 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00052Q96N35 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00052Q96N35 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00052Q96N35 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00052Q96N35 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00052Q96N35 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LINC00052Q96N35 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LINC00052Q96N35 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00052Q96N35 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00052Q96N35 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00052Q96N35 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00052Q96N35 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00052Q96N35 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00052Q96N35 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00052Q96N35 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00052Q96N35 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00052Q96N35 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00052Q96N35 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00052Q96N35 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00052Q96N35 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00052Q96N35 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00052Q96N35 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00052Q96N35 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00052Q96N35 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00052Q96N35 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00052Q96N35 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00052Q96N35 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00052Q96N35 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00052Q96N35 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00052Q96N35 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00052Q96N35 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00052Q96N35 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00052Q96N35 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00052Q96N35 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00052Q96N35 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00052Q96N35 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00052Q96N35 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00052Q96N35 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00052Q96N35 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00052Q96N35 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00052Q96N35 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00052Q96N35 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00052Q96N35 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00052Q96N35 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00052Q96N35 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00052Q96N35 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00052Q96N35 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00052Q96N35 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00052Q96N35 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00052Q96N35 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00052Q96N35 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00052Q96N35 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00052Q96N35 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00052Q96N35 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00052Q96N35 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00052Q96N35 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00052Q96N35 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms