Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF488Q96MN9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF488Q96MN9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF488Q96MN9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF488Q96MN9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF488Q96MN9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF488Q96MN9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF488Q96MN9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF488Q96MN9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF488Q96MN9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF488Q96MN9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF488Q96MN9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF488Q96MN9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF488Q96MN9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF488Q96MN9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF488Q96MN9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF488Q96MN9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF488Q96MN9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF488Q96MN9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF488Q96MN9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF488Q96MN9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF488Q96MN9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF488Q96MN9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF488Q96MN9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF488Q96MN9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF488Q96MN9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF488Q96MN9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF488Q96MN9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF488Q96MN9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF488Q96MN9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF488Q96MN9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF488Q96MN9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF488Q96MN9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF488Q96MN9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF488Q96MN9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF488Q96MN9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF488Q96MN9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF488Q96MN9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF488Q96MN9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF488Q96MN9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF488Q96MN9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF488Q96MN9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF488Q96MN9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF488Q96MN9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF488Q96MN9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF488Q96MN9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF488Q96MN9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF488Q96MN9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF488Q96MN9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF488Q96MN9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF488Q96MN9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF488Q96MN9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF488Q96MN9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF488Q96MN9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF488Q96MN9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF488Q96MN9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF488Q96MN9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF488Q96MN9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF488Q96MN9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF488Q96MN9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF488Q96MN9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF488Q96MN9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF488Q96MN9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF488Q96MN9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF488Q96MN9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF488Q96MN9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF488Q96MN9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF488Q96MN9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF488Q96MN9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF488Q96MN9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF488Q96MN9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF488Q96MN9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF488Q96MN9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF488Q96MN9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF488Q96MN9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF488Q96MN9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF488Q96MN9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF488Q96MN9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF488Q96MN9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF488Q96MN9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF488Q96MN9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF488Q96MN9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF488Q96MN9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF488Q96MN9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF488Q96MN9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF488Q96MN9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF488Q96MN9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF488Q96MN9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF488Q96MN9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF488Q96MN9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF488Q96MN9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF488Q96MN9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF488Q96MN9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF488Q96MN9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF488Q96MN9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF488Q96MN9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF488Q96MN9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF488Q96MN9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF488Q96MN9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF488Q96MN9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms