Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
BCANQ96GW7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
BCANQ96GW7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
BCANQ96GW7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
BCANQ96GW7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
BCANQ96GW7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
BCANQ96GW7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
BCANQ96GW7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
BCANQ96GW7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
BCANQ96GW7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
BCANQ96GW7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
BCANQ96GW7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
BCANQ96GW7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
BCANQ96GW7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
BCANQ96GW7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
BCANQ96GW7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
BCANQ96GW7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
BCANQ96GW7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
BCANQ96GW7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
BCANQ96GW7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
BCANQ96GW7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
BCANQ96GW7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37.76■■■■□ 3.64
BCANQ96GW7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
BCANQ96GW7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
BCANQ96GW7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
BCANQ96GW7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
BCANQ96GW7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC37.74■■■■□ 3.63
BCANQ96GW7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC37.74■■■■□ 3.63
BCANQ96GW7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
BCANQ96GW7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
BCANQ96GW7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
BCANQ96GW7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
BCANQ96GW7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
BCANQ96GW7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
BCANQ96GW7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
BCANQ96GW7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
BCANQ96GW7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
BCANQ96GW7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.69■■■■□ 3.62
BCANQ96GW7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
BCANQ96GW7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
BCANQ96GW7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
BCANQ96GW7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC37.67■■■■□ 3.62
BCANQ96GW7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
BCANQ96GW7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
BCANQ96GW7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
BCANQ96GW7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
BCANQ96GW7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
BCANQ96GW7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
BCANQ96GW7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
BCANQ96GW7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
BCANQ96GW7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
BCANQ96GW7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
BCANQ96GW7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
BCANQ96GW7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
BCANQ96GW7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
BCANQ96GW7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
BCANQ96GW7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
BCANQ96GW7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
BCANQ96GW7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
BCANQ96GW7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
BCANQ96GW7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
BCANQ96GW7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
BCANQ96GW7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
BCANQ96GW7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
BCANQ96GW7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
BCANQ96GW7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
BCANQ96GW7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
BCANQ96GW7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
BCANQ96GW7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
BCANQ96GW7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
BCANQ96GW7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
BCANQ96GW7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
BCANQ96GW7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
BCANQ96GW7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
BCANQ96GW7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
BCANQ96GW7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.52■■■■□ 3.6
BCANQ96GW7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
BCANQ96GW7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
BCANQ96GW7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
BCANQ96GW7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.49■■■■□ 3.59
BCANQ96GW7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
BCANQ96GW7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
BCANQ96GW7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
BCANQ96GW7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
BCANQ96GW7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
BCANQ96GW7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
BCANQ96GW7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
BCANQ96GW7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
BCANQ96GW7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
BCANQ96GW7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
BCANQ96GW7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
BCANQ96GW7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
BCANQ96GW7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
BCANQ96GW7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
BCANQ96GW7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
BCANQ96GW7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
BCANQ96GW7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
BCANQ96GW7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
BCANQ96GW7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
BCANQ96GW7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms