Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP9XQ93008 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP9XQ93008 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP9XQ93008 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP9XQ93008 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP9XQ93008 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
USP9XQ93008 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP9XQ93008 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
USP9XQ93008 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP9XQ93008 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP9XQ93008 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP9XQ93008 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP9XQ93008 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP9XQ93008 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP9XQ93008 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP9XQ93008 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP9XQ93008 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP9XQ93008 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP9XQ93008 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP9XQ93008 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP9XQ93008 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP9XQ93008 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP9XQ93008 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP9XQ93008 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP9XQ93008 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP9XQ93008 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP9XQ93008 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP9XQ93008 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP9XQ93008 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP9XQ93008 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP9XQ93008 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP9XQ93008 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP9XQ93008 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP9XQ93008 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP9XQ93008 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
USP9XQ93008 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP9XQ93008 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP9XQ93008 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP9XQ93008 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP9XQ93008 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP9XQ93008 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP9XQ93008 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP9XQ93008 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP9XQ93008 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP9XQ93008 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP9XQ93008 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP9XQ93008 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USP9XQ93008 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP9XQ93008 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP9XQ93008 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP9XQ93008 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP9XQ93008 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP9XQ93008 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP9XQ93008 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP9XQ93008 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP9XQ93008 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP9XQ93008 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP9XQ93008 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
USP9XQ93008 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP9XQ93008 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP9XQ93008 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP9XQ93008 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP9XQ93008 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP9XQ93008 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP9XQ93008 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP9XQ93008 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP9XQ93008 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP9XQ93008 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP9XQ93008 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP9XQ93008 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP9XQ93008 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP9XQ93008 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP9XQ93008 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP9XQ93008 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP9XQ93008 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USP9XQ93008 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP9XQ93008 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
USP9XQ93008 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP9XQ93008 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP9XQ93008 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP9XQ93008 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP9XQ93008 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP9XQ93008 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP9XQ93008 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP9XQ93008 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP9XQ93008 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP9XQ93008 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP9XQ93008 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP9XQ93008 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP9XQ93008 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP9XQ93008 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP9XQ93008 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP9XQ93008 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP9XQ93008 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP9XQ93008 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP9XQ93008 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP9XQ93008 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP9XQ93008 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP9XQ93008 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP9XQ93008 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms