Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF3Q92576 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF3Q92576 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF3Q92576 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF3Q92576 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF3Q92576 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF3Q92576 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF3Q92576 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF3Q92576 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF3Q92576 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF3Q92576 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF3Q92576 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF3Q92576 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PHF3Q92576 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF3Q92576 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF3Q92576 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF3Q92576 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF3Q92576 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF3Q92576 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF3Q92576 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF3Q92576 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF3Q92576 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF3Q92576 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF3Q92576 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF3Q92576 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF3Q92576 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF3Q92576 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF3Q92576 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF3Q92576 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF3Q92576 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF3Q92576 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF3Q92576 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF3Q92576 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF3Q92576 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF3Q92576 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF3Q92576 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF3Q92576 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF3Q92576 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHF3Q92576 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF3Q92576 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF3Q92576 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF3Q92576 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF3Q92576 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF3Q92576 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF3Q92576 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF3Q92576 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF3Q92576 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF3Q92576 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF3Q92576 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF3Q92576 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF3Q92576 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF3Q92576 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF3Q92576 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF3Q92576 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF3Q92576 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF3Q92576 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF3Q92576 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF3Q92576 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF3Q92576 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF3Q92576 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF3Q92576 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF3Q92576 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF3Q92576 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF3Q92576 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF3Q92576 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF3Q92576 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF3Q92576 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF3Q92576 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF3Q92576 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF3Q92576 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF3Q92576 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHF3Q92576 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF3Q92576 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF3Q92576 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF3Q92576 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF3Q92576 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF3Q92576 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF3Q92576 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF3Q92576 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF3Q92576 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF3Q92576 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF3Q92576 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF3Q92576 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF3Q92576 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF3Q92576 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF3Q92576 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF3Q92576 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF3Q92576 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHF3Q92576 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHF3Q92576 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHF3Q92576 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF3Q92576 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF3Q92576 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF3Q92576 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF3Q92576 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF3Q92576 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF3Q92576 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF3Q92576 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF3Q92576 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF3Q92576 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms