Protein–RNA interactions for Protein: Q8N695

SLC5A8, Sodium-coupled monocarboxylate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A8Q8N695 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A8Q8N695 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A8Q8N695 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A8Q8N695 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A8Q8N695 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A8Q8N695 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A8Q8N695 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A8Q8N695 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A8Q8N695 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A8Q8N695 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A8Q8N695 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A8Q8N695 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A8Q8N695 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A8Q8N695 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A8Q8N695 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A8Q8N695 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A8Q8N695 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A8Q8N695 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC5A8Q8N695 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC5A8Q8N695 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC5A8Q8N695 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC5A8Q8N695 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A8Q8N695 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A8Q8N695 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A8Q8N695 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A8Q8N695 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A8Q8N695 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A8Q8N695 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC5A8Q8N695 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC5A8Q8N695 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC5A8Q8N695 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC5A8Q8N695 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC5A8Q8N695 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC5A8Q8N695 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC5A8Q8N695 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC5A8Q8N695 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A8Q8N695 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A8Q8N695 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A8Q8N695 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A8Q8N695 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC5A8Q8N695 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A8Q8N695 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A8Q8N695 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A8Q8N695 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC5A8Q8N695 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A8Q8N695 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A8Q8N695 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A8Q8N695 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A8Q8N695 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC5A8Q8N695 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A8Q8N695 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC5A8Q8N695 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A8Q8N695 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC5A8Q8N695 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A8Q8N695 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A8Q8N695 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A8Q8N695 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A8Q8N695 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A8Q8N695 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC5A8Q8N695 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC5A8Q8N695 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A8Q8N695 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A8Q8N695 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A8Q8N695 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A8Q8N695 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms