Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RD3Q7Z3Z2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RD3Q7Z3Z2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RD3Q7Z3Z2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RD3Q7Z3Z2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RD3Q7Z3Z2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RD3Q7Z3Z2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RD3Q7Z3Z2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RD3Q7Z3Z2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RD3Q7Z3Z2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RD3Q7Z3Z2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RD3Q7Z3Z2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RD3Q7Z3Z2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RD3Q7Z3Z2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RD3Q7Z3Z2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RD3Q7Z3Z2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RD3Q7Z3Z2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RD3Q7Z3Z2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RD3Q7Z3Z2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RD3Q7Z3Z2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RD3Q7Z3Z2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RD3Q7Z3Z2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RD3Q7Z3Z2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RD3Q7Z3Z2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RD3Q7Z3Z2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RD3Q7Z3Z2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RD3Q7Z3Z2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RD3Q7Z3Z2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RD3Q7Z3Z2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RD3Q7Z3Z2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RD3Q7Z3Z2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RD3Q7Z3Z2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RD3Q7Z3Z2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RD3Q7Z3Z2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RD3Q7Z3Z2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RD3Q7Z3Z2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RD3Q7Z3Z2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RD3Q7Z3Z2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RD3Q7Z3Z2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RD3Q7Z3Z2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RD3Q7Z3Z2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RD3Q7Z3Z2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RD3Q7Z3Z2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RD3Q7Z3Z2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RD3Q7Z3Z2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RD3Q7Z3Z2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RD3Q7Z3Z2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RD3Q7Z3Z2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RD3Q7Z3Z2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RD3Q7Z3Z2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RD3Q7Z3Z2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RD3Q7Z3Z2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RD3Q7Z3Z2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RD3Q7Z3Z2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RD3Q7Z3Z2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RD3Q7Z3Z2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RD3Q7Z3Z2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RD3Q7Z3Z2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RD3Q7Z3Z2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RD3Q7Z3Z2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RD3Q7Z3Z2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RD3Q7Z3Z2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RD3Q7Z3Z2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RD3Q7Z3Z2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RD3Q7Z3Z2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RD3Q7Z3Z2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RD3Q7Z3Z2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RD3Q7Z3Z2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RD3Q7Z3Z2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RD3Q7Z3Z2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RD3Q7Z3Z2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RD3Q7Z3Z2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RD3Q7Z3Z2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RD3Q7Z3Z2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RD3Q7Z3Z2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RD3Q7Z3Z2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RD3Q7Z3Z2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RD3Q7Z3Z2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RD3Q7Z3Z2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RD3Q7Z3Z2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RD3Q7Z3Z2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RD3Q7Z3Z2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RD3Q7Z3Z2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RD3Q7Z3Z2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RD3Q7Z3Z2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RD3Q7Z3Z2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RD3Q7Z3Z2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RD3Q7Z3Z2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RD3Q7Z3Z2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RD3Q7Z3Z2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RD3Q7Z3Z2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RD3Q7Z3Z2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RD3Q7Z3Z2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RD3Q7Z3Z2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RD3Q7Z3Z2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RD3Q7Z3Z2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RD3Q7Z3Z2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RD3Q7Z3Z2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RD3Q7Z3Z2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RD3Q7Z3Z2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.7 ms