Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
KRT27Q7Z3Y8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
KRT27Q7Z3Y8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
KRT27Q7Z3Y8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
KRT27Q7Z3Y8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
KRT27Q7Z3Y8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
KRT27Q7Z3Y8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
KRT27Q7Z3Y8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
KRT27Q7Z3Y8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
KRT27Q7Z3Y8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
KRT27Q7Z3Y8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
KRT27Q7Z3Y8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
KRT27Q7Z3Y8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
KRT27Q7Z3Y8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
KRT27Q7Z3Y8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
KRT27Q7Z3Y8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
KRT27Q7Z3Y8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
KRT27Q7Z3Y8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
KRT27Q7Z3Y8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
KRT27Q7Z3Y8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
KRT27Q7Z3Y8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
KRT27Q7Z3Y8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
KRT27Q7Z3Y8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
KRT27Q7Z3Y8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
KRT27Q7Z3Y8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
KRT27Q7Z3Y8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
KRT27Q7Z3Y8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
KRT27Q7Z3Y8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
KRT27Q7Z3Y8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
KRT27Q7Z3Y8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
KRT27Q7Z3Y8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
KRT27Q7Z3Y8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
KRT27Q7Z3Y8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
KRT27Q7Z3Y8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
KRT27Q7Z3Y8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
KRT27Q7Z3Y8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
KRT27Q7Z3Y8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
KRT27Q7Z3Y8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
KRT27Q7Z3Y8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
KRT27Q7Z3Y8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
KRT27Q7Z3Y8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
KRT27Q7Z3Y8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
KRT27Q7Z3Y8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
KRT27Q7Z3Y8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
KRT27Q7Z3Y8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
KRT27Q7Z3Y8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
KRT27Q7Z3Y8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
KRT27Q7Z3Y8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
KRT27Q7Z3Y8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
KRT27Q7Z3Y8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
KRT27Q7Z3Y8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
KRT27Q7Z3Y8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
KRT27Q7Z3Y8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
KRT27Q7Z3Y8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
KRT27Q7Z3Y8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
KRT27Q7Z3Y8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
KRT27Q7Z3Y8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
KRT27Q7Z3Y8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
KRT27Q7Z3Y8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
KRT27Q7Z3Y8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
KRT27Q7Z3Y8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
KRT27Q7Z3Y8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
KRT27Q7Z3Y8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
KRT27Q7Z3Y8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
KRT27Q7Z3Y8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
KRT27Q7Z3Y8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
KRT27Q7Z3Y8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
KRT27Q7Z3Y8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
KRT27Q7Z3Y8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
KRT27Q7Z3Y8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
KRT27Q7Z3Y8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
KRT27Q7Z3Y8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
KRT27Q7Z3Y8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
KRT27Q7Z3Y8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
KRT27Q7Z3Y8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KRT27Q7Z3Y8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
KRT27Q7Z3Y8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
KRT27Q7Z3Y8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
KRT27Q7Z3Y8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
KRT27Q7Z3Y8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KRT27Q7Z3Y8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
KRT27Q7Z3Y8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
KRT27Q7Z3Y8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
KRT27Q7Z3Y8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
KRT27Q7Z3Y8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
KRT27Q7Z3Y8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
KRT27Q7Z3Y8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KRT27Q7Z3Y8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KRT27Q7Z3Y8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
KRT27Q7Z3Y8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
KRT27Q7Z3Y8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
KRT27Q7Z3Y8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
KRT27Q7Z3Y8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
KRT27Q7Z3Y8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
KRT27Q7Z3Y8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
KRT27Q7Z3Y8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
KRT27Q7Z3Y8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KRT27Q7Z3Y8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KRT27Q7Z3Y8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KRT27Q7Z3Y8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.7 ms