Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
XIRP1Q702N8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
XIRP1Q702N8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
XIRP1Q702N8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
XIRP1Q702N8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
XIRP1Q702N8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
XIRP1Q702N8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
XIRP1Q702N8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
XIRP1Q702N8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
XIRP1Q702N8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
XIRP1Q702N8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
XIRP1Q702N8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
XIRP1Q702N8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
XIRP1Q702N8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
XIRP1Q702N8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
XIRP1Q702N8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
XIRP1Q702N8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
XIRP1Q702N8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
XIRP1Q702N8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
XIRP1Q702N8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
XIRP1Q702N8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
XIRP1Q702N8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
XIRP1Q702N8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
XIRP1Q702N8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
XIRP1Q702N8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
XIRP1Q702N8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
XIRP1Q702N8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
XIRP1Q702N8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
XIRP1Q702N8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
XIRP1Q702N8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
XIRP1Q702N8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
XIRP1Q702N8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
XIRP1Q702N8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
XIRP1Q702N8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
XIRP1Q702N8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
XIRP1Q702N8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
XIRP1Q702N8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
XIRP1Q702N8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
XIRP1Q702N8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
XIRP1Q702N8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
XIRP1Q702N8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
XIRP1Q702N8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
XIRP1Q702N8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
XIRP1Q702N8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
XIRP1Q702N8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
XIRP1Q702N8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
XIRP1Q702N8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
XIRP1Q702N8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
XIRP1Q702N8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
XIRP1Q702N8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
XIRP1Q702N8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
XIRP1Q702N8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
XIRP1Q702N8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
XIRP1Q702N8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
XIRP1Q702N8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
XIRP1Q702N8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
XIRP1Q702N8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
XIRP1Q702N8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
XIRP1Q702N8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
XIRP1Q702N8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
XIRP1Q702N8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
XIRP1Q702N8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
XIRP1Q702N8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
XIRP1Q702N8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
XIRP1Q702N8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
XIRP1Q702N8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
XIRP1Q702N8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
XIRP1Q702N8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
XIRP1Q702N8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
XIRP1Q702N8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
XIRP1Q702N8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
XIRP1Q702N8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
XIRP1Q702N8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
XIRP1Q702N8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
XIRP1Q702N8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
XIRP1Q702N8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
XIRP1Q702N8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
XIRP1Q702N8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
XIRP1Q702N8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
XIRP1Q702N8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
XIRP1Q702N8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
XIRP1Q702N8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
XIRP1Q702N8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
XIRP1Q702N8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
XIRP1Q702N8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
XIRP1Q702N8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
XIRP1Q702N8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
XIRP1Q702N8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
XIRP1Q702N8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
XIRP1Q702N8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
XIRP1Q702N8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
XIRP1Q702N8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
XIRP1Q702N8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
XIRP1Q702N8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
XIRP1Q702N8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
XIRP1Q702N8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
XIRP1Q702N8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
XIRP1Q702N8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
XIRP1Q702N8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
XIRP1Q702N8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms