Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW60

PCSK4, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 4, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK4Q6UW60 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCSK4Q6UW60 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCSK4Q6UW60 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCSK4Q6UW60 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCSK4Q6UW60 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCSK4Q6UW60 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCSK4Q6UW60 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCSK4Q6UW60 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCSK4Q6UW60 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCSK4Q6UW60 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCSK4Q6UW60 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PCSK4Q6UW60 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCSK4Q6UW60 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCSK4Q6UW60 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCSK4Q6UW60 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCSK4Q6UW60 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCSK4Q6UW60 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCSK4Q6UW60 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCSK4Q6UW60 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCSK4Q6UW60 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCSK4Q6UW60 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCSK4Q6UW60 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCSK4Q6UW60 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCSK4Q6UW60 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCSK4Q6UW60 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCSK4Q6UW60 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCSK4Q6UW60 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCSK4Q6UW60 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCSK4Q6UW60 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCSK4Q6UW60 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCSK4Q6UW60 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PCSK4Q6UW60 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCSK4Q6UW60 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCSK4Q6UW60 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCSK4Q6UW60 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCSK4Q6UW60 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCSK4Q6UW60 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCSK4Q6UW60 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCSK4Q6UW60 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCSK4Q6UW60 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCSK4Q6UW60 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCSK4Q6UW60 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCSK4Q6UW60 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCSK4Q6UW60 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCSK4Q6UW60 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCSK4Q6UW60 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PCSK4Q6UW60 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCSK4Q6UW60 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PCSK4Q6UW60 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCSK4Q6UW60 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCSK4Q6UW60 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCSK4Q6UW60 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCSK4Q6UW60 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCSK4Q6UW60 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCSK4Q6UW60 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCSK4Q6UW60 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCSK4Q6UW60 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK4Q6UW60 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCSK4Q6UW60 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCSK4Q6UW60 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCSK4Q6UW60 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCSK4Q6UW60 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCSK4Q6UW60 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCSK4Q6UW60 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCSK4Q6UW60 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCSK4Q6UW60 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCSK4Q6UW60 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCSK4Q6UW60 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCSK4Q6UW60 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCSK4Q6UW60 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PCSK4Q6UW60 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCSK4Q6UW60 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCSK4Q6UW60 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCSK4Q6UW60 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCSK4Q6UW60 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCSK4Q6UW60 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCSK4Q6UW60 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCSK4Q6UW60 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCSK4Q6UW60 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCSK4Q6UW60 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCSK4Q6UW60 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PCSK4Q6UW60 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCSK4Q6UW60 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PCSK4Q6UW60 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCSK4Q6UW60 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCSK4Q6UW60 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PCSK4Q6UW60 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCSK4Q6UW60 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCSK4Q6UW60 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCSK4Q6UW60 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCSK4Q6UW60 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCSK4Q6UW60 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCSK4Q6UW60 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCSK4Q6UW60 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCSK4Q6UW60 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCSK4Q6UW60 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCSK4Q6UW60 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCSK4Q6UW60 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCSK4Q6UW60 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCSK4Q6UW60 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.9 ms