Protein–RNA interactions for Protein: Q6P499

NIPAL3, NIPA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL3Q6P499 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIPAL3Q6P499 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIPAL3Q6P499 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIPAL3Q6P499 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIPAL3Q6P499 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIPAL3Q6P499 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIPAL3Q6P499 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIPAL3Q6P499 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIPAL3Q6P499 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIPAL3Q6P499 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIPAL3Q6P499 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NIPAL3Q6P499 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NIPAL3Q6P499 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NIPAL3Q6P499 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NIPAL3Q6P499 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NIPAL3Q6P499 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIPAL3Q6P499 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NIPAL3Q6P499 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIPAL3Q6P499 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIPAL3Q6P499 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIPAL3Q6P499 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NIPAL3Q6P499 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIPAL3Q6P499 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIPAL3Q6P499 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIPAL3Q6P499 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPAL3Q6P499 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPAL3Q6P499 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPAL3Q6P499 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPAL3Q6P499 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPAL3Q6P499 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPAL3Q6P499 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPAL3Q6P499 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPAL3Q6P499 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPAL3Q6P499 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPAL3Q6P499 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPAL3Q6P499 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPAL3Q6P499 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPAL3Q6P499 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPAL3Q6P499 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPAL3Q6P499 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPAL3Q6P499 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPAL3Q6P499 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPAL3Q6P499 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPAL3Q6P499 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPAL3Q6P499 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPAL3Q6P499 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPAL3Q6P499 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPAL3Q6P499 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPAL3Q6P499 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPAL3Q6P499 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NIPAL3Q6P499 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIPAL3Q6P499 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIPAL3Q6P499 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPAL3Q6P499 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPAL3Q6P499 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPAL3Q6P499 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPAL3Q6P499 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPAL3Q6P499 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIPAL3Q6P499 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIPAL3Q6P499 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIPAL3Q6P499 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIPAL3Q6P499 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIPAL3Q6P499 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIPAL3Q6P499 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIPAL3Q6P499 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIPAL3Q6P499 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIPAL3Q6P499 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIPAL3Q6P499 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIPAL3Q6P499 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIPAL3Q6P499 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIPAL3Q6P499 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIPAL3Q6P499 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIPAL3Q6P499 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIPAL3Q6P499 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIPAL3Q6P499 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIPAL3Q6P499 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NIPAL3Q6P499 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIPAL3Q6P499 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIPAL3Q6P499 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIPAL3Q6P499 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIPAL3Q6P499 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIPAL3Q6P499 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIPAL3Q6P499 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIPAL3Q6P499 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIPAL3Q6P499 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NIPAL3Q6P499 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPAL3Q6P499 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPAL3Q6P499 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPAL3Q6P499 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPAL3Q6P499 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPAL3Q6P499 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPAL3Q6P499 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPAL3Q6P499 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPAL3Q6P499 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPAL3Q6P499 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPAL3Q6P499 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPAL3Q6P499 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPAL3Q6P499 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NIPAL3Q6P499 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPAL3Q6P499 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms