Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC38Q5VT99 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC38Q5VT99 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC38Q5VT99 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC38Q5VT99 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC38Q5VT99 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC38Q5VT99 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC38Q5VT99 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC38Q5VT99 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC38Q5VT99 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC38Q5VT99 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC38Q5VT99 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC38Q5VT99 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC38Q5VT99 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC38Q5VT99 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC38Q5VT99 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC38Q5VT99 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC38Q5VT99 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC38Q5VT99 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC38Q5VT99 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC38Q5VT99 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC38Q5VT99 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC38Q5VT99 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC38Q5VT99 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC38Q5VT99 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC38Q5VT99 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC38Q5VT99 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC38Q5VT99 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC38Q5VT99 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC38Q5VT99 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC38Q5VT99 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC38Q5VT99 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRRC38Q5VT99 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC38Q5VT99 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC38Q5VT99 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC38Q5VT99 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC38Q5VT99 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC38Q5VT99 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC38Q5VT99 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC38Q5VT99 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC38Q5VT99 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC38Q5VT99 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC38Q5VT99 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC38Q5VT99 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC38Q5VT99 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC38Q5VT99 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC38Q5VT99 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC38Q5VT99 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC38Q5VT99 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC38Q5VT99 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC38Q5VT99 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC38Q5VT99 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC38Q5VT99 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC38Q5VT99 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC38Q5VT99 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC38Q5VT99 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC38Q5VT99 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRRC38Q5VT99 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC38Q5VT99 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC38Q5VT99 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC38Q5VT99 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC38Q5VT99 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC38Q5VT99 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC38Q5VT99 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC38Q5VT99 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC38Q5VT99 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC38Q5VT99 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC38Q5VT99 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC38Q5VT99 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC38Q5VT99 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC38Q5VT99 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC38Q5VT99 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC38Q5VT99 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC38Q5VT99 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC38Q5VT99 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC38Q5VT99 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC38Q5VT99 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC38Q5VT99 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC38Q5VT99 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC38Q5VT99 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC38Q5VT99 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC38Q5VT99 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC38Q5VT99 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC38Q5VT99 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC38Q5VT99 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC38Q5VT99 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC38Q5VT99 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC38Q5VT99 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC38Q5VT99 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC38Q5VT99 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC38Q5VT99 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC38Q5VT99 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC38Q5VT99 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC38Q5VT99 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC38Q5VT99 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC38Q5VT99 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC38Q5VT99 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC38Q5VT99 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC38Q5VT99 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC38Q5VT99 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms