Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4D3

TMTC4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC4Q5T4D3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMTC4Q5T4D3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMTC4Q5T4D3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMTC4Q5T4D3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMTC4Q5T4D3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMTC4Q5T4D3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMTC4Q5T4D3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMTC4Q5T4D3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMTC4Q5T4D3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMTC4Q5T4D3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMTC4Q5T4D3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMTC4Q5T4D3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TMTC4Q5T4D3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMTC4Q5T4D3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMTC4Q5T4D3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMTC4Q5T4D3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMTC4Q5T4D3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMTC4Q5T4D3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMTC4Q5T4D3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMTC4Q5T4D3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMTC4Q5T4D3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMTC4Q5T4D3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMTC4Q5T4D3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMTC4Q5T4D3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMTC4Q5T4D3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMTC4Q5T4D3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMTC4Q5T4D3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMTC4Q5T4D3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMTC4Q5T4D3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMTC4Q5T4D3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMTC4Q5T4D3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMTC4Q5T4D3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMTC4Q5T4D3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMTC4Q5T4D3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMTC4Q5T4D3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMTC4Q5T4D3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMTC4Q5T4D3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMTC4Q5T4D3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMTC4Q5T4D3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMTC4Q5T4D3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMTC4Q5T4D3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMTC4Q5T4D3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMTC4Q5T4D3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMTC4Q5T4D3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMTC4Q5T4D3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMTC4Q5T4D3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMTC4Q5T4D3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMTC4Q5T4D3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMTC4Q5T4D3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMTC4Q5T4D3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMTC4Q5T4D3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMTC4Q5T4D3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMTC4Q5T4D3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMTC4Q5T4D3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMTC4Q5T4D3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMTC4Q5T4D3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMTC4Q5T4D3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMTC4Q5T4D3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMTC4Q5T4D3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMTC4Q5T4D3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMTC4Q5T4D3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMTC4Q5T4D3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMTC4Q5T4D3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMTC4Q5T4D3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMTC4Q5T4D3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMTC4Q5T4D3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMTC4Q5T4D3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMTC4Q5T4D3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMTC4Q5T4D3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMTC4Q5T4D3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMTC4Q5T4D3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMTC4Q5T4D3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMTC4Q5T4D3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMTC4Q5T4D3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMTC4Q5T4D3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMTC4Q5T4D3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMTC4Q5T4D3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TMTC4Q5T4D3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMTC4Q5T4D3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMTC4Q5T4D3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMTC4Q5T4D3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMTC4Q5T4D3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMTC4Q5T4D3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMTC4Q5T4D3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMTC4Q5T4D3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMTC4Q5T4D3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMTC4Q5T4D3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMTC4Q5T4D3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMTC4Q5T4D3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMTC4Q5T4D3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMTC4Q5T4D3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TMTC4Q5T4D3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMTC4Q5T4D3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMTC4Q5T4D3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMTC4Q5T4D3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMTC4Q5T4D3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMTC4Q5T4D3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMTC4Q5T4D3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMTC4Q5T4D3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMTC4Q5T4D3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms