Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYF9

KRTAP19-7, Keratin-associated protein 19-7, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP19-7Q3SYF9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
KRTAP19-7Q3SYF9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP19-7Q3SYF9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms