Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNW1

SNAI3, Zinc finger protein SNAI3, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3Q3KNW1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAI3Q3KNW1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAI3Q3KNW1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAI3Q3KNW1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAI3Q3KNW1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAI3Q3KNW1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAI3Q3KNW1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAI3Q3KNW1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAI3Q3KNW1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAI3Q3KNW1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAI3Q3KNW1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAI3Q3KNW1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAI3Q3KNW1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAI3Q3KNW1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAI3Q3KNW1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAI3Q3KNW1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAI3Q3KNW1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAI3Q3KNW1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAI3Q3KNW1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAI3Q3KNW1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAI3Q3KNW1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAI3Q3KNW1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAI3Q3KNW1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNAI3Q3KNW1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAI3Q3KNW1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAI3Q3KNW1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAI3Q3KNW1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAI3Q3KNW1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAI3Q3KNW1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAI3Q3KNW1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAI3Q3KNW1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAI3Q3KNW1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAI3Q3KNW1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAI3Q3KNW1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAI3Q3KNW1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAI3Q3KNW1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAI3Q3KNW1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAI3Q3KNW1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAI3Q3KNW1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAI3Q3KNW1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAI3Q3KNW1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAI3Q3KNW1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAI3Q3KNW1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAI3Q3KNW1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAI3Q3KNW1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAI3Q3KNW1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAI3Q3KNW1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAI3Q3KNW1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAI3Q3KNW1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAI3Q3KNW1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAI3Q3KNW1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNAI3Q3KNW1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAI3Q3KNW1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAI3Q3KNW1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAI3Q3KNW1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAI3Q3KNW1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAI3Q3KNW1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAI3Q3KNW1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAI3Q3KNW1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAI3Q3KNW1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAI3Q3KNW1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAI3Q3KNW1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAI3Q3KNW1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAI3Q3KNW1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAI3Q3KNW1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAI3Q3KNW1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAI3Q3KNW1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAI3Q3KNW1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAI3Q3KNW1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAI3Q3KNW1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAI3Q3KNW1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAI3Q3KNW1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAI3Q3KNW1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAI3Q3KNW1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAI3Q3KNW1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAI3Q3KNW1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAI3Q3KNW1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAI3Q3KNW1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNAI3Q3KNW1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAI3Q3KNW1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAI3Q3KNW1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAI3Q3KNW1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAI3Q3KNW1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAI3Q3KNW1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAI3Q3KNW1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAI3Q3KNW1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAI3Q3KNW1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAI3Q3KNW1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAI3Q3KNW1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAI3Q3KNW1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAI3Q3KNW1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAI3Q3KNW1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAI3Q3KNW1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAI3Q3KNW1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAI3Q3KNW1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAI3Q3KNW1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAI3Q3KNW1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAI3Q3KNW1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAI3Q3KNW1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAI3Q3KNW1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms