Protein–RNA interactions for Protein: Q12177

YLL056C, Uncharacterized protein YLL056C, yeastyeast

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL056CQ12177 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt8.53□□□□□ -1.04
YLL056CQ12177 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt8.53□□□□□ -1.04
YLL056CQ12177 MOB1YIL106W 945 nt8.53□□□□□ -1.04
YLL056CQ12177 FLX1YIL134W 936 nt8.53□□□□□ -1.04
YLL056CQ12177 NAP1YKR048C 1254 nt8.53□□□□□ -1.04
YLL056CQ12177 GAS1YMR307W 1680 nt8.53□□□□□ -1.04
YLL056CQ12177 PAU19YMR325W 375 nt8.52□□□□□ -1.05
YLL056CQ12177 IPL1YPL209C 1104 nt8.52□□□□□ -1.05
YLL056CQ12177 THI3YDL080C 1830 nt8.52□□□□□ -1.05
YLL056CQ12177 PTC6YCR079W 1329 nt8.52□□□□□ -1.05
YLL056CQ12177 VBA3YCL069W 1377 nt8.51□□□□□ -1.05
YLL056CQ12177 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt8.51□□□□□ -1.05
YLL056CQ12177 YBL095WYBL095W 813 nt8.51□□□□□ -1.05
YLL056CQ12177 ACO2YJL200C 2370 nt8.51□□□□□ -1.05
YLL056CQ12177 ENO1YGR254W 1314 nt8.5□□□□□ -1.05
YLL056CQ12177 FRE6YLL051C 2139 nt8.5□□□□□ -1.05
YLL056CQ12177 NPP2YEL016C 1482 nt8.49□□□□□ -1.05
YLL056CQ12177 YCR025CYCR025C 411 nt8.47□□□□□ -1.05
YLL056CQ12177 LYS20YDL182W 1287 nt8.46□□□□□ -1.06
YLL056CQ12177 CYC3YAL039C 810 nt8.45□□□□□ -1.06
YLL056CQ12177 YMC2YBR104W 990 nt8.45□□□□□ -1.06
YLL056CQ12177 RSM7YJR113C 744 nt8.44□□□□□ -1.06
YLL056CQ12177 PUP1YOR157C 786 nt8.43□□□□□ -1.06
YLL056CQ12177 SRP102YKL154W 735 nt8.42□□□□□ -1.06
YLL056CQ12177 YFR020WYFR020W 699 nt8.41□□□□□ -1.06
YLL056CQ12177 MRS4YKR052C 915 nt8.41□□□□□ -1.06
YLL056CQ12177 YLR280CYLR280C 351 nt8.4□□□□□ -1.06
YLL056CQ12177 AAC3YBR085W 924 nt8.4□□□□□ -1.06
YLL056CQ12177 YHL008CYHL008C 1884 nt8.4□□□□□ -1.07
YLL056CQ12177 NBA1YOL070C 1506 nt8.39□□□□□ -1.07
YLL056CQ12177 AAT1YKL106W 1356 nt8.39□□□□□ -1.07
YLL056CQ12177 TMS1YDR105C 1422 nt8.37□□□□□ -1.07
YLL056CQ12177 MTO1YGL236C 2010 nt8.37□□□□□ -1.07
YLL056CQ12177 ERO1YML130C 1692 nt8.37□□□□□ -1.07
YLL056CQ12177 SER2YGR208W 930 nt8.37□□□□□ -1.07
YLL056CQ12177 TPN1YGL186C 1740 nt8.36□□□□□ -1.07
YLL056CQ12177 SLG1YOR008C 1137 nt8.35□□□□□ -1.07
YLL056CQ12177 GID7YCL039W 2238 nt8.34□□□□□ -1.07
YLL056CQ12177 HTS1YPR033C 1641 nt8.34□□□□□ -1.07
YLL056CQ12177 FET5YFL041W 1869 nt8.34□□□□□ -1.07
YLL056CQ12177 YJL009WYJL009W 327 nt8.33□□□□□ -1.08
YLL056CQ12177 YLR460CYLR460C 1131 nt8.33□□□□□ -1.08
YLL056CQ12177 TRP2YER090W 1524 nt8.33□□□□□ -1.08
YLL056CQ12177 MET2YNL277W 1461 nt8.32□□□□□ -1.08
YLL056CQ12177 YIR035CYIR035C 765 nt8.32□□□□□ -1.08
YLL056CQ12177 THI6YPL214C 1623 nt8.32□□□□□ -1.08
YLL056CQ12177 TPO4YOR273C 1980 nt8.31□□□□□ -1.08
YLL056CQ12177 snR86snR86 1004 nt8.31□□□□□ -1.08
YLL056CQ12177 TGA1tA(UGC)A 73 nt8.3□□□□□ -1.08
YLL056CQ12177 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt8.3□□□□□ -1.08
YLL056CQ12177 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt8.3□□□□□ -1.08
YLL056CQ12177 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt8.3□□□□□ -1.08
YLL056CQ12177 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt8.3□□□□□ -1.08
YLL056CQ12177 YJR149WYJR149W 1215 nt8.3□□□□□ -1.08
YLL056CQ12177 BUB2YMR055C 921 nt8.3□□□□□ -1.08
YLL056CQ12177 YCP4YCR004C 744 nt8.29□□□□□ -1.08
YLL056CQ12177 YGR210CYGR210C 1236 nt8.29□□□□□ -1.08
YLL056CQ12177 EMC3YKL207W 762 nt8.29□□□□□ -1.08
YLL056CQ12177 SAM50YNL026W 1455 nt8.29□□□□□ -1.08
YLL056CQ12177 CHS7YHR142W 951 nt8.28□□□□□ -1.08
YLL056CQ12177 HXT11YOL156W 1704 nt8.27□□□□□ -1.09
YLL056CQ12177 YBR056WYBR056W 1506 nt8.27□□□□□ -1.09
YLL056CQ12177 SWM1YDR260C 513 nt8.26□□□□□ -1.09
YLL056CQ12177 YMR166CYMR166C 1107 nt8.25□□□□□ -1.09
YLL056CQ12177 MET22YOL064C 1074 nt8.25□□□□□ -1.09
YLL056CQ12177 OLA1YBR025C 1185 nt8.25□□□□□ -1.09
YLL056CQ12177 FCY1YPR062W 477 nt8.25□□□□□ -1.09
YLL056CQ12177 YPL108WYPL108W 507 nt8.24□□□□□ -1.09
YLL056CQ12177 YRF1-3YGR296W 5580 nt8.24□□□□□ -1.09
YLL056CQ12177 YRF1-6YNL339C 5580 nt8.24□□□□□ -1.09
YLL056CQ12177 YRF1-7YPL283C 5580 nt8.24□□□□□ -1.09
YLL056CQ12177 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.23□□□□□ -1.09
YLL056CQ12177 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.23□□□□□ -1.09
YLL056CQ12177 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.23□□□□□ -1.09
YLL056CQ12177 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.23□□□□□ -1.09
YLL056CQ12177 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.23□□□□□ -1.09
YLL056CQ12177 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.23□□□□□ -1.09
YLL056CQ12177 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.23□□□□□ -1.09
YLL056CQ12177 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.23□□□□□ -1.09
YLL056CQ12177 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.23□□□□□ -1.09
YLL056CQ12177 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.23□□□□□ -1.09
YLL056CQ12177 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.23□□□□□ -1.09
YLL056CQ12177 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.23□□□□□ -1.09
YLL056CQ12177 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.23□□□□□ -1.09
YLL056CQ12177 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.23□□□□□ -1.09
YLL056CQ12177 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.23□□□□□ -1.09
YLL056CQ12177 YLR072WYLR072W 2082 nt8.23□□□□□ -1.09
YLL056CQ12177 MEP1YGR121C 1479 nt8.22□□□□□ -1.09
YLL056CQ12177 OCH1YGL038C 1443 nt8.21□□□□□ -1.09
YLL056CQ12177 RNA170RNA170 169 nt8.21□□□□□ -1.1
YLL056CQ12177 LSP1YPL004C 1026 nt8.2□□□□□ -1.1
YLL056CQ12177 YMR210WYMR210W 1350 nt8.2□□□□□ -1.1
YLL056CQ12177 SFP1YLR403W 2052 nt8.2□□□□□ -1.1
YLL056CQ12177 SRM1YGL097W 1449 nt8.2□□□□□ -1.1
YLL056CQ12177 PDC6YGR087C 1692 nt8.19□□□□□ -1.1
YLL056CQ12177 CAK1YFL029C 1107 nt8.19□□□□□ -1.1
YLL056CQ12177 YMR007WYMR007W 381 nt8.19□□□□□ -1.1
YLL056CQ12177 NPP1YCR026C 2229 nt8.19□□□□□ -1.1
YLL056CQ12177 YIL177CYIL177C 5277 nt8.18□□□□□ -1.1
YLL056CQ12177 MIM1YOL026C 342 nt8.17□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 94.2 ms