Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 KGD2YDR148C 1392 nt8.06□□□□□ -1.12
NMD4Q12129 SRP54YPR088C 1626 nt8.06□□□□□ -1.12
NMD4Q12129 GTB1YDR221W 2109 nt8.05□□□□□ -1.12
NMD4Q12129 YKR012CYKR012C 378 nt8.05□□□□□ -1.12
NMD4Q12129 REX2YLR059C 810 nt8.04□□□□□ -1.12
NMD4Q12129 HXT10YFL011W 1641 nt8.03□□□□□ -1.12
NMD4Q12129 INH1YDL181W 258 nt8.03□□□□□ -1.12
NMD4Q12129 LEU4YNL104C 1860 nt8.02□□□□□ -1.12
NMD4Q12129 SAN1YDR143C 1833 nt8.02□□□□□ -1.13
NMD4Q12129 SBP1YHL034C 885 nt8.02□□□□□ -1.13
NMD4Q12129 YDR467CYDR467C 327 nt8.01□□□□□ -1.13
NMD4Q12129 NAS6YGR232W 687 nt8□□□□□ -1.13
NMD4Q12129 MOB1YIL106W 945 nt8□□□□□ -1.13
NMD4Q12129 CDD1YLR245C 429 nt8□□□□□ -1.13
NMD4Q12129 YJL064WYJL064W 396 nt7.99□□□□□ -1.13
NMD4Q12129 NAP1YKR048C 1254 nt7.99□□□□□ -1.13
NMD4Q12129 ADH3YMR083W 1128 nt7.99□□□□□ -1.13
NMD4Q12129 PHB2YGR231C 933 nt7.98□□□□□ -1.13
NMD4Q12129 YPT11YNL304W 1254 nt7.98□□□□□ -1.13
NMD4Q12129 YOR072WYOR072W 315 nt7.98□□□□□ -1.13
NMD4Q12129 GAL2YLR081W 1725 nt7.98□□□□□ -1.13
NMD4Q12129 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt7.97□□□□□ -1.13
NMD4Q12129 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt7.97□□□□□ -1.13
NMD4Q12129 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt7.97□□□□□ -1.13
NMD4Q12129 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt7.97□□□□□ -1.13
NMD4Q12129 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt7.97□□□□□ -1.13
NMD4Q12129 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt7.97□□□□□ -1.13
NMD4Q12129 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt7.97□□□□□ -1.13
NMD4Q12129 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt7.97□□□□□ -1.13
NMD4Q12129 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt7.97□□□□□ -1.13
NMD4Q12129 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt7.97□□□□□ -1.13
NMD4Q12129 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt7.97□□□□□ -1.13
NMD4Q12129 GPM1YKL152C 744 nt7.97□□□□□ -1.13
NMD4Q12129 IPL1YPL209C 1104 nt7.97□□□□□ -1.13
NMD4Q12129 GAS1YMR307W 1680 nt7.97□□□□□ -1.13
NMD4Q12129 SDS24YBR214W 1584 nt7.97□□□□□ -1.13
NMD4Q12129 AGP3YFL055W 1677 nt7.96□□□□□ -1.13
NMD4Q12129 GGA2YHR108W 1758 nt7.96□□□□□ -1.14
NMD4Q12129 PTC6YCR079W 1329 nt7.96□□□□□ -1.14
NMD4Q12129 FLX1YIL134W 936 nt7.95□□□□□ -1.14
NMD4Q12129 ENO1YGR254W 1314 nt7.95□□□□□ -1.14
NMD4Q12129 PAU19YMR325W 375 nt7.94□□□□□ -1.14
NMD4Q12129 VBA3YCL069W 1377 nt7.94□□□□□ -1.14
NMD4Q12129 YCR025CYCR025C 411 nt7.93□□□□□ -1.14
NMD4Q12129 YBL095WYBL095W 813 nt7.93□□□□□ -1.14
NMD4Q12129 NBA1YOL070C 1506 nt7.93□□□□□ -1.14
NMD4Q12129 THI3YDL080C 1830 nt7.92□□□□□ -1.14
NMD4Q12129 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.92□□□□□ -1.14
NMD4Q12129 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.92□□□□□ -1.14
NMD4Q12129 CYC3YAL039C 810 nt7.92□□□□□ -1.14
NMD4Q12129 YMC2YBR104W 990 nt7.92□□□□□ -1.14
NMD4Q12129 RSM7YJR113C 744 nt7.91□□□□□ -1.14
NMD4Q12129 LYS20YDL182W 1287 nt7.9□□□□□ -1.14
NMD4Q12129 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.9□□□□□ -1.14
NMD4Q12129 MEX67YPL169C 1800 nt7.89□□□□□ -1.15
NMD4Q12129 NPP2YEL016C 1482 nt7.89□□□□□ -1.15
NMD4Q12129 TOK1YJL093C 2076 nt7.88□□□□□ -1.15
NMD4Q12129 MDL2YPL270W 2322 nt7.87□□□□□ -1.15
NMD4Q12129 YLR280CYLR280C 351 nt7.86□□□□□ -1.15
NMD4Q12129 PUP1YOR157C 786 nt7.86□□□□□ -1.15
NMD4Q12129 YFR020WYFR020W 699 nt7.85□□□□□ -1.15
NMD4Q12129 MRS4YKR052C 915 nt7.85□□□□□ -1.15
NMD4Q12129 MTO1YGL236C 2010 nt7.85□□□□□ -1.15
NMD4Q12129 SRP102YKL154W 735 nt7.84□□□□□ -1.15
NMD4Q12129 AAT1YKL106W 1356 nt7.83□□□□□ -1.16
NMD4Q12129 SER2YGR208W 930 nt7.82□□□□□ -1.16
NMD4Q12129 YLR460CYLR460C 1131 nt7.81□□□□□ -1.16
NMD4Q12129 AAC3YBR085W 924 nt7.81□□□□□ -1.16
NMD4Q12129 ERO1YML130C 1692 nt7.81□□□□□ -1.16
NMD4Q12129 CBK1YNL161W 2271 nt7.8□□□□□ -1.16
NMD4Q12129 SLG1YOR008C 1137 nt7.8□□□□□ -1.16
NMD4Q12129 TPN1YGL186C 1740 nt7.8□□□□□ -1.16
NMD4Q12129 TMS1YDR105C 1422 nt7.78□□□□□ -1.16
NMD4Q12129 HTS1YPR033C 1641 nt7.78□□□□□ -1.16
NMD4Q12129 YIR035CYIR035C 765 nt7.78□□□□□ -1.16
NMD4Q12129 YJL009WYJL009W 327 nt7.78□□□□□ -1.16
NMD4Q12129 MLS1YNL117W 1665 nt7.76□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 YGR210CYGR210C 1236 nt7.76□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 YJR149WYJR149W 1215 nt7.76□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 EMC3YKL207W 762 nt7.76□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 SAM50YNL026W 1455 nt7.75□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 YCP4YCR004C 744 nt7.75□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.75□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.75□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.75□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.75□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.75□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.75□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.75□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.75□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.75□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.75□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.75□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.75□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.75□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.75□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.75□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 CHS7YHR142W 951 nt7.75□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 MIM1YOL026C 342 nt7.75□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 TRP2YER090W 1524 nt7.74□□□□□ -1.17
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