Protein–RNA interactions for Protein: Q07527

TRM3, tRNA (guanosine(18)-2'-O)-methyltransferase, yeastyeast

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Length 1,436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM3Q07527 SAC7YDR389W 1965 nt12.14□□□□□ -0.47
TRM3Q07527 YJL043WYJL043W 774 nt12.13□□□□□ -0.47
TRM3Q07527 PBP1YGR178C 2169 nt12.09□□□□□ -0.47
TRM3Q07527 YDL086WYDL086W 822 nt12.09□□□□□ -0.47
TRM3Q07527 SWT21YNL187W 1074 nt12.08□□□□□ -0.48
TRM3Q07527 CYT2YKL087C 675 nt12.05□□□□□ -0.48
TRM3Q07527 KGD2YDR148C 1392 nt12.05□□□□□ -0.48
TRM3Q07527 SRP54YPR088C 1626 nt12.04□□□□□ -0.48
TRM3Q07527 SPG1YGR236C 288 nt12.03□□□□□ -0.48
TRM3Q07527 YLR358CYLR358C 564 nt12.01□□□□□ -0.49
TRM3Q07527 RPS6AYPL090C 711 nt12.01□□□□□ -0.49
TRM3Q07527 RPS6BYBR181C 711 nt12.01□□□□□ -0.49
TRM3Q07527 TDH1YJL052W 999 nt12□□□□□ -0.49
TRM3Q07527 RPR1RPR1 369 nt12□□□□□ -0.49
TRM3Q07527 NUP53YMR153W 1428 nt11.99□□□□□ -0.49
TRM3Q07527 SRY1YKL218C 981 nt11.99□□□□□ -0.49
TRM3Q07527 YLR046CYLR046C 813 nt11.99□□□□□ -0.49
TRM3Q07527 YPR084WYPR084W 1371 nt11.99□□□□□ -0.49
TRM3Q07527 YKL053WYKL053W 375 nt11.97□□□□□ -0.49
TRM3Q07527 ENT4YLL038C 744 nt11.96□□□□□ -0.49
TRM3Q07527 MET1YKR069W 1782 nt11.95□□□□□ -0.5
TRM3Q07527 KEL3YPL263C 1956 nt11.95□□□□□ -0.5
TRM3Q07527 YER156CYER156C 1017 nt11.94□□□□□ -0.5
TRM3Q07527 RSM7YJR113C 744 nt11.94□□□□□ -0.5
TRM3Q07527 YAT1YAR035W 2064 nt11.93□□□□□ -0.5
TRM3Q07527 YPT11YNL304W 1254 nt11.93□□□□□ -0.5
TRM3Q07527 YFR020WYFR020W 699 nt11.91□□□□□ -0.5
TRM3Q07527 SFL1YOR140W 2301 nt11.9□□□□□ -0.5
TRM3Q07527 CAK1YFL029C 1107 nt11.88□□□□□ -0.51
TRM3Q07527 URA1YKL216W 945 nt11.88□□□□□ -0.51
TRM3Q07527 BXI1YNL305C 894 nt11.88□□□□□ -0.51
TRM3Q07527 snR31snR31 225 nt11.86□□□□□ -0.51
TRM3Q07527 CCT2YIL142W 1584 nt11.85□□□□□ -0.51
TRM3Q07527 YML079WYML079W 606 nt11.85□□□□□ -0.51
TRM3Q07527 YDR476CYDR476C 675 nt11.84□□□□□ -0.51
TRM3Q07527 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt11.84□□□□□ -0.51
TRM3Q07527 RRT14YIL127C 621 nt11.84□□□□□ -0.51
TRM3Q07527 YIL168WYIL168W 384 nt11.84□□□□□ -0.51
TRM3Q07527 RRT6YGL146C 936 nt11.83□□□□□ -0.52
TRM3Q07527 HAP5YOR358W 729 nt11.83□□□□□ -0.52
TRM3Q07527 MAS2YHR024C 1449 nt11.82□□□□□ -0.52
TRM3Q07527 OCH1YGL038C 1443 nt11.81□□□□□ -0.52
TRM3Q07527 YLR460CYLR460C 1131 nt11.8□□□□□ -0.52
TRM3Q07527 CRC1YOR100C 984 nt11.8□□□□□ -0.52
TRM3Q07527 CMP2YML057W 1815 nt11.8□□□□□ -0.52
TRM3Q07527 ILV3YJR016C 1758 nt11.79□□□□□ -0.52
TRM3Q07527 PUP2YGR253C 783 nt11.79□□□□□ -0.52
TRM3Q07527 SBP1YHL034C 885 nt11.77□□□□□ -0.52
TRM3Q07527 SUV3YPL029W 2214 nt11.77□□□□□ -0.52
TRM3Q07527 SAN1YDR143C 1833 nt11.77□□□□□ -0.53
TRM3Q07527 PTC6YCR079W 1329 nt11.77□□□□□ -0.53
TRM3Q07527 YMR265CYMR265C 1386 nt11.76□□□□□ -0.53
TRM3Q07527 HAC1YFL031W 717 nt11.76□□□□□ -0.53
TRM3Q07527 CHS7YHR142W 951 nt11.76□□□□□ -0.53
TRM3Q07527 ITR2YOL103W 1830 nt11.75□□□□□ -0.53
TRM3Q07527 RPN14YGL004C 1254 nt11.71□□□□□ -0.53
TRM3Q07527 YOR111WYOR111W 699 nt11.7□□□□□ -0.54
TRM3Q07527 GAS1YMR307W 1680 nt11.7□□□□□ -0.54
TRM3Q07527 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt11.69□□□□□ -0.54
TRM3Q07527 NCA3YJL116C 1014 nt11.67□□□□□ -0.54
TRM3Q07527 YPT31YER031C 672 nt11.66□□□□□ -0.54
TRM3Q07527 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt11.66□□□□□ -0.54
TRM3Q07527 LAT1YNL071W 1449 nt11.66□□□□□ -0.54
TRM3Q07527 DLD3YEL071W 1491 nt11.66□□□□□ -0.54
TRM3Q07527 OPI10YOL032W 741 nt11.65□□□□□ -0.54
TRM3Q07527 VMA11YPL234C 495 nt11.65□□□□□ -0.54
TRM3Q07527 YJL144WYJL144W 315 nt11.63□□□□□ -0.55
TRM3Q07527 MET22YOL064C 1074 nt11.63□□□□□ -0.55
TRM3Q07527 SLM3YDL033C 1254 nt11.61□□□□□ -0.55
TRM3Q07527 OLA1YBR025C 1185 nt11.61□□□□□ -0.55
TRM3Q07527 YOX1YML027W 1158 nt11.6□□□□□ -0.55
TRM3Q07527 YOR325WYOR325W 474 nt11.6□□□□□ -0.55
TRM3Q07527 LSR1LSR1 1175 nt11.59□□□□□ -0.55
TRM3Q07527 PSP2YML017W 1782 nt11.58□□□□□ -0.56
TRM3Q07527 RHO1YPR165W 630 nt11.57□□□□□ -0.56
TRM3Q07527 RPC82YPR190C 1965 nt11.56□□□□□ -0.56
TRM3Q07527 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt11.56□□□□□ -0.56
TRM3Q07527 YHR219WYHR219W 1875 nt11.56□□□□□ -0.56
TRM3Q07527 DOC1YGL240W 753 nt11.55□□□□□ -0.56
TRM3Q07527 POR2YIL114C 846 nt11.55□□□□□ -0.56
TRM3Q07527 ATP2YJR121W 1536 nt11.55□□□□□ -0.56
TRM3Q07527 PDC6YGR087C 1692 nt11.54□□□□□ -0.56
TRM3Q07527 HSL7YBR133C 2484 nt11.54□□□□□ -0.56
TRM3Q07527 YBL111CYBL111C 2004 nt11.53□□□□□ -0.56
TRM3Q07527 PIH1YHR034C 1035 nt11.52□□□□□ -0.56
TRM3Q07527 SPT20YOL148C 1815 nt11.51□□□□□ -0.57
TRM3Q07527 ATP23YNR020C 813 nt11.51□□□□□ -0.57
TRM3Q07527 SNX3YOR357C 489 nt11.5□□□□□ -0.57
TRM3Q07527 INA1YLR413W 2028 nt11.49□□□□□ -0.57
TRM3Q07527 THI73YLR004C 1572 nt11.48□□□□□ -0.57
TRM3Q07527 AIM46YHR199C 933 nt11.47□□□□□ -0.57
TRM3Q07527 CPT1YNL130C 1182 nt11.46□□□□□ -0.57
TRM3Q07527 SPR1YOR190W 1338 nt11.46□□□□□ -0.57
TRM3Q07527 PNS1YOR161C 1620 nt11.46□□□□□ -0.58
TRM3Q07527 PUS4YNL292W 1212 nt11.45□□□□□ -0.58
TRM3Q07527 GID8YMR135C 1368 nt11.45□□□□□ -0.58
TRM3Q07527 SHC1YER096W 1539 nt11.45□□□□□ -0.58
TRM3Q07527 CYS3YAL012W 1185 nt11.44□□□□□ -0.58
TRM3Q07527 APT1YML022W 564 nt11.44□□□□□ -0.58
TRM3Q07527 UME1YPL139C 1383 nt11.44□□□□□ -0.58
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