Protein–RNA interactions for Protein: Q03790

NUP53, Nucleoporin NUP53, yeastyeast

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP53Q03790 snR31snR31 225 nt7.59□□□□□ -1.19
NUP53Q03790 REX2YLR059C 810 nt7.58□□□□□ -1.2
NUP53Q03790 YLR280CYLR280C 351 nt7.58□□□□□ -1.2
NUP53Q03790 SFL1YOR140W 2301 nt7.57□□□□□ -1.2
NUP53Q03790 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.56□□□□□ -1.2
NUP53Q03790 YPL108WYPL108W 507 nt7.56□□□□□ -1.2
NUP53Q03790 GRH1YDR517W 1119 nt7.55□□□□□ -1.2
NUP53Q03790 ELO1YJL196C 933 nt7.55□□□□□ -1.2
NUP53Q03790 DLD3YEL071W 1491 nt7.55□□□□□ -1.2
NUP53Q03790 YDR306CYDR306C 1437 nt7.54□□□□□ -1.2
NUP53Q03790 SUV3YPL029W 2214 nt7.54□□□□□ -1.2
NUP53Q03790 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.54□□□□□ -1.2
NUP53Q03790 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.54□□□□□ -1.2
NUP53Q03790 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.54□□□□□ -1.2
NUP53Q03790 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.54□□□□□ -1.2
NUP53Q03790 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.54□□□□□ -1.2
NUP53Q03790 RPN14YGL004C 1254 nt7.54□□□□□ -1.2
NUP53Q03790 RIM2YBR192W 1134 nt7.54□□□□□ -1.2
NUP53Q03790 YJR154WYJR154W 1041 nt7.53□□□□□ -1.2
NUP53Q03790 YPT11YNL304W 1254 nt7.53□□□□□ -1.2
NUP53Q03790 HAP5YOR358W 729 nt7.53□□□□□ -1.2
NUP53Q03790 YMR265CYMR265C 1386 nt7.53□□□□□ -1.2
NUP53Q03790 MET1YKR069W 1782 nt7.53□□□□□ -1.2
NUP53Q03790 SRP54YPR088C 1626 nt7.52□□□□□ -1.2
NUP53Q03790 YFR020WYFR020W 699 nt7.52□□□□□ -1.21
NUP53Q03790 FCY1YPR062W 477 nt7.52□□□□□ -1.21
NUP53Q03790 ITR2YOL103W 1830 nt7.52□□□□□ -1.21
NUP53Q03790 MRP1YDR347W 966 nt7.51□□□□□ -1.21
NUP53Q03790 YJL160CYJL160C 864 nt7.51□□□□□ -1.21
NUP53Q03790 YRF1-2YER190W 5046 nt7.5□□□□□ -1.21
NUP53Q03790 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.49□□□□□ -1.21
NUP53Q03790 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.49□□□□□ -1.21
NUP53Q03790 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.49□□□□□ -1.21
NUP53Q03790 EMC3YKL207W 762 nt7.49□□□□□ -1.21
NUP53Q03790 VMA11YPL234C 495 nt7.49□□□□□ -1.21
NUP53Q03790 RSC4YKR008W 1878 nt7.49□□□□□ -1.21
NUP53Q03790 YKL053WYKL053W 375 nt7.48□□□□□ -1.21
NUP53Q03790 YOR268CYOR268C 399 nt7.48□□□□□ -1.21
NUP53Q03790 ARO8YGL202W 1503 nt7.47□□□□□ -1.21
NUP53Q03790 MUP1YGR055W 1725 nt7.47□□□□□ -1.21
NUP53Q03790 CRC1YOR100C 984 nt7.47□□□□□ -1.21
NUP53Q03790 SAN1YDR143C 1833 nt7.47□□□□□ -1.21
NUP53Q03790 GAL2YLR081W 1725 nt7.47□□□□□ -1.21
NUP53Q03790 EDC2YER035W 438 nt7.46□□□□□ -1.22
NUP53Q03790 YMR166CYMR166C 1107 nt7.45□□□□□ -1.22
NUP53Q03790 PUS7YOR243C 2031 nt7.45□□□□□ -1.22
NUP53Q03790 YMR210WYMR210W 1350 nt7.45□□□□□ -1.22
NUP53Q03790 TOK1YJL093C 2076 nt7.44□□□□□ -1.22
NUP53Q03790 RSM7YJR113C 744 nt7.44□□□□□ -1.22
NUP53Q03790 YHR219WYHR219W 1875 nt7.43□□□□□ -1.22
NUP53Q03790 KRR1YCL059C 951 nt7.43□□□□□ -1.22
NUP53Q03790 KES1YPL145C 1305 nt7.43□□□□□ -1.22
NUP53Q03790 GID8YMR135C 1368 nt7.42□□□□□ -1.22
NUP53Q03790 GDH1YOR375C 1365 nt7.42□□□□□ -1.22
NUP53Q03790 COQ8YGL119W 1506 nt7.42□□□□□ -1.22
NUP53Q03790 RRT14YIL127C 621 nt7.41□□□□□ -1.22
NUP53Q03790 SNX3YOR357C 489 nt7.41□□□□□ -1.22
NUP53Q03790 MFG1YDL233W 1377 nt7.41□□□□□ -1.22
NUP53Q03790 LSP1YPL004C 1026 nt7.4□□□□□ -1.22
NUP53Q03790 SGA1YIL099W 1650 nt7.39□□□□□ -1.23
NUP53Q03790 GAS1YMR307W 1680 nt7.39□□□□□ -1.23
NUP53Q03790 RPD3YNL330C 1302 nt7.39□□□□□ -1.23
NUP53Q03790 ZAP1YJL056C 2643 nt7.38□□□□□ -1.23
NUP53Q03790 KGD2YDR148C 1392 nt7.38□□□□□ -1.23
NUP53Q03790 ADA2YDR448W 1305 nt7.38□□□□□ -1.23
NUP53Q03790 YER156CYER156C 1017 nt7.38□□□□□ -1.23
NUP53Q03790 SBP1YHL034C 885 nt7.38□□□□□ -1.23
NUP53Q03790 MFT1YML062C 1179 nt7.38□□□□□ -1.23
NUP53Q03790 LSR1LSR1 1175 nt7.38□□□□□ -1.23
NUP53Q03790 YKL133CYKL133C 1392 nt7.37□□□□□ -1.23
NUP53Q03790 TAD2YJL035C 753 nt7.37□□□□□ -1.23
NUP53Q03790 YLR460CYLR460C 1131 nt7.37□□□□□ -1.23
NUP53Q03790 YHL008CYHL008C 1884 nt7.36□□□□□ -1.23
NUP53Q03790 HOL1YNR055C 1761 nt7.36□□□□□ -1.23
NUP53Q03790 PTC6YCR079W 1329 nt7.36□□□□□ -1.23
NUP53Q03790 CWP2YKL096W-A 279 nt7.36□□□□□ -1.23
NUP53Q03790 MRS6YOR370C 1812 nt7.36□□□□□ -1.23
NUP53Q03790 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.35□□□□□ -1.23
NUP53Q03790 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.35□□□□□ -1.23
NUP53Q03790 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.35□□□□□ -1.23
NUP53Q03790 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.35□□□□□ -1.23
NUP53Q03790 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.35□□□□□ -1.23
NUP53Q03790 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.35□□□□□ -1.23
NUP53Q03790 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.35□□□□□ -1.23
NUP53Q03790 PET18YCR020C 648 nt7.34□□□□□ -1.23
NUP53Q03790 CAK1YFL029C 1107 nt7.34□□□□□ -1.23
NUP53Q03790 CHS7YHR142W 951 nt7.33□□□□□ -1.24
NUP53Q03790 OCH1YGL038C 1443 nt7.32□□□□□ -1.24
NUP53Q03790 MET22YOL064C 1074 nt7.3□□□□□ -1.24
NUP53Q03790 ELP4YPL101W 1371 nt7.3□□□□□ -1.24
NUP53Q03790 HXK1YFR053C 1458 nt7.3□□□□□ -1.24
NUP53Q03790 GNP1YDR508C 1992 nt7.29□□□□□ -1.24
NUP53Q03790 YIL177CYIL177C 5277 nt7.29□□□□□ -1.24
NUP53Q03790 YPR084WYPR084W 1371 nt7.29□□□□□ -1.24
NUP53Q03790 PDC6YGR087C 1692 nt7.28□□□□□ -1.24
NUP53Q03790 UTR5YEL035C 501 nt7.28□□□□□ -1.24
NUP53Q03790 RPC31YNL151C 756 nt7.28□□□□□ -1.24
NUP53Q03790 SSL2YIL143C 2532 nt7.27□□□□□ -1.25
NUP53Q03790 HIS2YFR025C 1008 nt7.27□□□□□ -1.25
NUP53Q03790 YMR206WYMR206W 942 nt7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.4 ms