Protein–RNA interactions for Protein: Q02100

SKO1, CRE-binding bZIP protein SKO1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKO1Q02100 ABZ2YMR289W 1125 nt7.38□□□□□ -1.23
SKO1Q02100 SLG1YOR008C 1137 nt7.38□□□□□ -1.23
SKO1Q02100 MEX67YPL169C 1800 nt7.37□□□□□ -1.23
SKO1Q02100 CDD1YLR245C 429 nt7.37□□□□□ -1.23
SKO1Q02100 SNX3YOR357C 489 nt7.37□□□□□ -1.23
SKO1Q02100 OPI3YJR073C 621 nt7.36□□□□□ -1.23
SKO1Q02100 TIP1YBR067C 633 nt7.36□□□□□ -1.23
SKO1Q02100 THI6YPL214C 1623 nt7.36□□□□□ -1.23
SKO1Q02100 SFL1YOR140W 2301 nt7.36□□□□□ -1.23
SKO1Q02100 HBS1YKR084C 1836 nt7.34□□□□□ -1.23
SKO1Q02100 DUR3YHL016C 2208 nt7.34□□□□□ -1.23
SKO1Q02100 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.34□□□□□ -1.23
SKO1Q02100 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.34□□□□□ -1.23
SKO1Q02100 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.34□□□□□ -1.23
SKO1Q02100 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.34□□□□□ -1.23
SKO1Q02100 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.34□□□□□ -1.23
SKO1Q02100 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.34□□□□□ -1.23
SKO1Q02100 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.34□□□□□ -1.23
SKO1Q02100 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.34□□□□□ -1.23
SKO1Q02100 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.34□□□□□ -1.23
SKO1Q02100 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.34□□□□□ -1.23
SKO1Q02100 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.34□□□□□ -1.23
SKO1Q02100 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.34□□□□□ -1.23
SKO1Q02100 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.34□□□□□ -1.23
SKO1Q02100 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.34□□□□□ -1.23
SKO1Q02100 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.34□□□□□ -1.23
SKO1Q02100 NAS2YIL007C 663 nt7.34□□□□□ -1.23
SKO1Q02100 NPP2YEL016C 1482 nt7.34□□□□□ -1.23
SKO1Q02100 MLS1YNL117W 1665 nt7.33□□□□□ -1.24
SKO1Q02100 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.33□□□□□ -1.24
SKO1Q02100 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.33□□□□□ -1.24
SKO1Q02100 MTO1YGL236C 2010 nt7.32□□□□□ -1.24
SKO1Q02100 INH1YDL181W 258 nt7.32□□□□□ -1.24
SKO1Q02100 SUV3YPL029W 2214 nt7.32□□□□□ -1.24
SKO1Q02100 GCD11YER025W 1584 nt7.31□□□□□ -1.24
SKO1Q02100 KRE1YNL322C 942 nt7.31□□□□□ -1.24
SKO1Q02100 THP3YPR045C 1413 nt7.31□□□□□ -1.24
SKO1Q02100 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt7.3□□□□□ -1.24
SKO1Q02100 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt7.3□□□□□ -1.24
SKO1Q02100 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt7.3□□□□□ -1.24
SKO1Q02100 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt7.3□□□□□ -1.24
SKO1Q02100 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt7.3□□□□□ -1.24
SKO1Q02100 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt7.3□□□□□ -1.24
SKO1Q02100 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt7.3□□□□□ -1.24
SKO1Q02100 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt7.3□□□□□ -1.24
SKO1Q02100 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt7.3□□□□□ -1.24
SKO1Q02100 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt7.3□□□□□ -1.24
SKO1Q02100 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt7.3□□□□□ -1.24
SKO1Q02100 HXT11YOL156W 1704 nt7.3□□□□□ -1.24
SKO1Q02100 MGM101YJR144W 810 nt7.29□□□□□ -1.24
SKO1Q02100 FSH2YMR222C 672 nt7.29□□□□□ -1.24
SKO1Q02100 YNR064CYNR064C 873 nt7.29□□□□□ -1.24
SKO1Q02100 MIM1YOL026C 342 nt7.29□□□□□ -1.24
SKO1Q02100 IPL1YPL209C 1104 nt7.29□□□□□ -1.24
SKO1Q02100 YMR265CYMR265C 1386 nt7.29□□□□□ -1.24
SKO1Q02100 CBK1YNL161W 2271 nt7.29□□□□□ -1.24
SKO1Q02100 AMF1YOR378W 1548 nt7.27□□□□□ -1.25
SKO1Q02100 YLR072WYLR072W 2082 nt7.27□□□□□ -1.25
SKO1Q02100 ENO2YHR174W 1314 nt7.27□□□□□ -1.25
SKO1Q02100 YCP4YCR004C 744 nt7.26□□□□□ -1.25
SKO1Q02100 SPE2YOL052C 1191 nt7.26□□□□□ -1.25
SKO1Q02100 MAM3YOL060C 2121 nt7.26□□□□□ -1.25
SKO1Q02100 ALR1YOL130W 2580 nt7.25□□□□□ -1.25
SKO1Q02100 YCR025CYCR025C 411 nt7.25□□□□□ -1.25
SKO1Q02100 FLX1YIL134W 936 nt7.25□□□□□ -1.25
SKO1Q02100 ELO1YJL196C 933 nt7.25□□□□□ -1.25
SKO1Q02100 DUS3YLR401C 2007 nt7.24□□□□□ -1.25
SKO1Q02100 TRP2YER090W 1524 nt7.24□□□□□ -1.25
SKO1Q02100 TPC1YGR096W 945 nt7.24□□□□□ -1.25
SKO1Q02100 HAP5YOR358W 729 nt7.24□□□□□ -1.25
SKO1Q02100 PHB2YGR231C 933 nt7.23□□□□□ -1.25
SKO1Q02100 YIA6YIL006W 1122 nt7.23□□□□□ -1.25
SKO1Q02100 RIB1YBL033C 1038 nt7.23□□□□□ -1.25
SKO1Q02100 FIT1YDR534C 1587 nt7.22□□□□□ -1.25
SKO1Q02100 ADH3YMR083W 1128 nt7.22□□□□□ -1.25
SKO1Q02100 LEU2YCL018W 1095 nt7.22□□□□□ -1.25
SKO1Q02100 SAM50YNL026W 1455 nt7.22□□□□□ -1.25
SKO1Q02100 SRM1YGL097W 1449 nt7.21□□□□□ -1.25
SKO1Q02100 KEL3YPL263C 1956 nt7.21□□□□□ -1.26
SKO1Q02100 YDR467CYDR467C 327 nt7.21□□□□□ -1.26
SKO1Q02100 SWT21YNL187W 1074 nt7.21□□□□□ -1.26
SKO1Q02100 SWM1YDR260C 513 nt7.2□□□□□ -1.26
SKO1Q02100 YEL023CYEL023C 2049 nt7.19□□□□□ -1.26
SKO1Q02100 YIL177CYIL177C 5277 nt7.18□□□□□ -1.26
SKO1Q02100 CRC1YOR100C 984 nt7.18□□□□□ -1.26
SKO1Q02100 NAM8YHR086W 1572 nt7.17□□□□□ -1.26
SKO1Q02100 LYS20YDL182W 1287 nt7.17□□□□□ -1.26
SKO1Q02100 SOD2YHR008C 702 nt7.17□□□□□ -1.26
SKO1Q02100 MOB1YIL106W 945 nt7.17□□□□□ -1.26
SKO1Q02100 CYC3YAL039C 810 nt7.17□□□□□ -1.26
SKO1Q02100 YHR131CYHR131C 2553 nt7.16□□□□□ -1.26
SKO1Q02100 THI3YDL080C 1830 nt7.16□□□□□ -1.26
SKO1Q02100 UFD1YGR048W 1086 nt7.16□□□□□ -1.26
SKO1Q02100 GPM1YKL152C 744 nt7.16□□□□□ -1.26
SKO1Q02100 YKR012CYKR012C 378 nt7.16□□□□□ -1.26
SKO1Q02100 ERG6YML008C 1152 nt7.16□□□□□ -1.26
SKO1Q02100 ORT1YOR130C 879 nt7.16□□□□□ -1.26
SKO1Q02100 snR31snR31 225 nt7.16□□□□□ -1.26
SKO1Q02100 RPN14YGL004C 1254 nt7.15□□□□□ -1.26
SKO1Q02100 SER2YGR208W 930 nt7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 117.1 ms