Protein–RNA interactions for Protein: Q01813

PFKP, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKPQ01813 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PFKPQ01813 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PFKPQ01813 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PFKPQ01813 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PFKPQ01813 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PFKPQ01813 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PFKPQ01813 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
PFKPQ01813 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PFKPQ01813 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PFKPQ01813 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PFKPQ01813 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PFKPQ01813 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PFKPQ01813 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PFKPQ01813 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PFKPQ01813 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PFKPQ01813 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PFKPQ01813 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PFKPQ01813 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PFKPQ01813 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PFKPQ01813 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PFKPQ01813 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PFKPQ01813 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms