Protein–RNA interactions for Protein: Q01813

PFKP, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKPQ01813 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PFKPQ01813 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PFKPQ01813 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PFKPQ01813 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PFKPQ01813 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PFKPQ01813 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PFKPQ01813 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
PFKPQ01813 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PFKPQ01813 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PFKPQ01813 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PFKPQ01813 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PFKPQ01813 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PFKPQ01813 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PFKPQ01813 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PFKPQ01813 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PFKPQ01813 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PFKPQ01813 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PFKPQ01813 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PFKPQ01813 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PFKPQ01813 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PFKPQ01813 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PFKPQ01813 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PFKPQ01813 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PFKPQ01813 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PFKPQ01813 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PFKPQ01813 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms