Protein–RNA interactions for Protein: Q01454

CTF4, DNA polymerase alpha-binding protein, yeastyeast

Predictions only

Length 927 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF4Q01454 YPL108WYPL108W 507 nt10.5□□□□□ -0.73
CTF4Q01454 VMA11YPL234C 495 nt10.5□□□□□ -0.73
CTF4Q01454 PAU22YPL282C 495 nt10.5□□□□□ -0.73
CTF4Q01454 HRA1HRA1 564 nt10.49□□□□□ -0.73
CTF4Q01454 EMC3YKL207W 762 nt10.49□□□□□ -0.73
CTF4Q01454 YKL133CYKL133C 1392 nt10.49□□□□□ -0.73
CTF4Q01454 GID7YCL039W 2238 nt10.48□□□□□ -0.73
CTF4Q01454 YPT11YNL304W 1254 nt10.47□□□□□ -0.73
CTF4Q01454 SNX3YOR357C 489 nt10.47□□□□□ -0.73
CTF4Q01454 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt10.46□□□□□ -0.73
CTF4Q01454 LSP1YPL004C 1026 nt10.46□□□□□ -0.73
CTF4Q01454 COQ8YGL119W 1506 nt10.46□□□□□ -0.74
CTF4Q01454 YFR020WYFR020W 699 nt10.45□□□□□ -0.74
CTF4Q01454 YHR219WYHR219W 1875 nt10.44□□□□□ -0.74
CTF4Q01454 CMP2YML057W 1815 nt10.44□□□□□ -0.74
CTF4Q01454 RSM7YJR113C 744 nt10.44□□□□□ -0.74
CTF4Q01454 MRS6YOR370C 1812 nt10.44□□□□□ -0.74
CTF4Q01454 YMR210WYMR210W 1350 nt10.43□□□□□ -0.74
CTF4Q01454 YJL160CYJL160C 864 nt10.43□□□□□ -0.74
CTF4Q01454 SAN1YDR143C 1833 nt10.42□□□□□ -0.74
CTF4Q01454 RPD3YNL330C 1302 nt10.42□□□□□ -0.74
CTF4Q01454 RPL12BYDR418W 498 nt10.42□□□□□ -0.74
CTF4Q01454 KGD2YDR148C 1392 nt10.41□□□□□ -0.74
CTF4Q01454 PTC6YCR079W 1329 nt10.4□□□□□ -0.74
CTF4Q01454 SGA1YIL099W 1650 nt10.38□□□□□ -0.75
CTF4Q01454 GAS1YMR307W 1680 nt10.38□□□□□ -0.75
CTF4Q01454 YMR166CYMR166C 1107 nt10.36□□□□□ -0.75
CTF4Q01454 ESBP6YNL125C 2022 nt10.36□□□□□ -0.75
CTF4Q01454 MRP1YDR347W 966 nt10.35□□□□□ -0.75
CTF4Q01454 SBP1YHL034C 885 nt10.35□□□□□ -0.75
CTF4Q01454 HOL1YNR055C 1761 nt10.34□□□□□ -0.75
CTF4Q01454 YLR460CYLR460C 1131 nt10.34□□□□□ -0.75
CTF4Q01454 MFT1YML062C 1179 nt10.32□□□□□ -0.76
CTF4Q01454 PET18YCR020C 648 nt10.3□□□□□ -0.76
CTF4Q01454 HIS2YFR025C 1008 nt10.3□□□□□ -0.76
CTF4Q01454 YOR268CYOR268C 399 nt10.3□□□□□ -0.76
CTF4Q01454 KAE1YKR038C 1161 nt10.28□□□□□ -0.76
CTF4Q01454 GDH1YOR375C 1365 nt10.27□□□□□ -0.76
CTF4Q01454 CAK1YFL029C 1107 nt10.27□□□□□ -0.77
CTF4Q01454 RRT14YIL127C 621 nt10.27□□□□□ -0.77
CTF4Q01454 UTR5YEL035C 501 nt10.26□□□□□ -0.77
CTF4Q01454 CHS7YHR142W 951 nt10.25□□□□□ -0.77
CTF4Q01454 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt10.24□□□□□ -0.77
CTF4Q01454 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt10.24□□□□□ -0.77
CTF4Q01454 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt10.24□□□□□ -0.77
CTF4Q01454 SUP51tL(UAA)J 84 nt10.24□□□□□ -0.77
CTF4Q01454 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt10.24□□□□□ -0.77
CTF4Q01454 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt10.24□□□□□ -0.77
CTF4Q01454 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt10.24□□□□□ -0.77
CTF4Q01454 OLA1YBR025C 1185 nt10.24□□□□□ -0.77
CTF4Q01454 RPC31YNL151C 756 nt10.22□□□□□ -0.77
CTF4Q01454 ADA2YDR448W 1305 nt10.22□□□□□ -0.77
CTF4Q01454 YPR084WYPR084W 1371 nt10.22□□□□□ -0.77
CTF4Q01454 KRR1YCL059C 951 nt10.21□□□□□ -0.77
CTF4Q01454 YJR149WYJR149W 1215 nt10.21□□□□□ -0.77
CTF4Q01454 OCH1YGL038C 1443 nt10.21□□□□□ -0.78
CTF4Q01454 YMR206WYMR206W 942 nt10.2□□□□□ -0.78
CTF4Q01454 MET22YOL064C 1074 nt10.2□□□□□ -0.78
CTF4Q01454 UGP1YKL035W 1500 nt10.19□□□□□ -0.78
CTF4Q01454 TOS1YBR162C 1368 nt10.19□□□□□ -0.78
CTF4Q01454 ZAP1YJL056C 2643 nt10.19□□□□□ -0.78
CTF4Q01454 TAD2YJL035C 753 nt10.18□□□□□ -0.78
CTF4Q01454 GGA2YHR108W 1758 nt10.17□□□□□ -0.78
CTF4Q01454 RPS6AYPL090C 711 nt10.17□□□□□ -0.78
CTF4Q01454 RPS6BYBR181C 711 nt10.17□□□□□ -0.78
CTF4Q01454 NPP1YCR026C 2229 nt10.17□□□□□ -0.78
CTF4Q01454 RFC1YOR217W 2586 nt10.16□□□□□ -0.78
CTF4Q01454 YPT31YER031C 672 nt10.16□□□□□ -0.78
CTF4Q01454 ELP4YPL101W 1371 nt10.15□□□□□ -0.78
CTF4Q01454 CWP2YKL096W-A 279 nt10.15□□□□□ -0.78
CTF4Q01454 DTR1YBR180W 1719 nt10.13□□□□□ -0.79
CTF4Q01454 YER156CYER156C 1017 nt10.13□□□□□ -0.79
CTF4Q01454 SSL2YIL143C 2532 nt10.13□□□□□ -0.79
CTF4Q01454 BXI1YNL305C 894 nt10.12□□□□□ -0.79
CTF4Q01454 MFG1YDL233W 1377 nt10.12□□□□□ -0.79
CTF4Q01454 EDC2YER035W 438 nt10.11□□□□□ -0.79
CTF4Q01454 THI3YDL080C 1830 nt10.1□□□□□ -0.79
CTF4Q01454 YDR467CYDR467C 327 nt10.1□□□□□ -0.79
CTF4Q01454 TDH1YJL052W 999 nt10.1□□□□□ -0.79
CTF4Q01454 GPM1YKL152C 744 nt10.1□□□□□ -0.79
CTF4Q01454 ODC1YPL134C 933 nt10.1□□□□□ -0.79
CTF4Q01454 SDH8YBR269C 417 nt10.1□□□□□ -0.79
CTF4Q01454 DPL1YDR294C 1770 nt10.1□□□□□ -0.79
CTF4Q01454 PDC6YGR087C 1692 nt10.09□□□□□ -0.79
CTF4Q01454 YJL043WYJL043W 774 nt10.09□□□□□ -0.79
CTF4Q01454 ILV2YMR108W 2064 nt10.09□□□□□ -0.79
CTF4Q01454 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt10.08□□□□□ -0.8
CTF4Q01454 YIR035CYIR035C 765 nt10.06□□□□□ -0.8
CTF4Q01454 ADE1YAR015W 921 nt10.06□□□□□ -0.8
CTF4Q01454 HOG1YLR113W 1308 nt10.06□□□□□ -0.8
CTF4Q01454 PET494YNR045W 1470 nt10.05□□□□□ -0.8
CTF4Q01454 SFP1YLR403W 2052 nt10.05□□□□□ -0.8
CTF4Q01454 RHO1YPR165W 630 nt10.05□□□□□ -0.8
CTF4Q01454 PRE5YMR314W 705 nt10.04□□□□□ -0.8
CTF4Q01454 YMC2YBR104W 990 nt10.04□□□□□ -0.8
CTF4Q01454 THI73YLR004C 1572 nt10.04□□□□□ -0.8
CTF4Q01454 BAP3YDR046C 1815 nt10.03□□□□□ -0.8
CTF4Q01454 YIL168WYIL168W 384 nt10.03□□□□□ -0.8
CTF4Q01454 RNA170RNA170 169 nt10.03□□□□□ -0.8
CTF4Q01454 HEM14YER014W 1620 nt10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.4 ms