Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP46P62068 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP46P62068 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP46P62068 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP46P62068 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP46P62068 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP46P62068 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP46P62068 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP46P62068 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP46P62068 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
USP46P62068 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP46P62068 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP46P62068 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP46P62068 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
USP46P62068 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
USP46P62068 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP46P62068 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP46P62068 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP46P62068 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP46P62068 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP46P62068 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
USP46P62068 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP46P62068 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP46P62068 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP46P62068 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP46P62068 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP46P62068 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
USP46P62068 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP46P62068 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
USP46P62068 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP46P62068 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP46P62068 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP46P62068 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP46P62068 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP46P62068 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
USP46P62068 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP46P62068 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP46P62068 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP46P62068 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP46P62068 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP46P62068 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP46P62068 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP46P62068 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP46P62068 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP46P62068 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP46P62068 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP46P62068 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP46P62068 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP46P62068 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP46P62068 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
USP46P62068 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
USP46P62068 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
USP46P62068 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
USP46P62068 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
USP46P62068 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
USP46P62068 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
USP46P62068 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
USP46P62068 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
USP46P62068 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP46P62068 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP46P62068 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP46P62068 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
USP46P62068 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP46P62068 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP46P62068 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP46P62068 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP46P62068 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP46P62068 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP46P62068 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP46P62068 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP46P62068 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP46P62068 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP46P62068 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP46P62068 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP46P62068 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP46P62068 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP46P62068 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP46P62068 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP46P62068 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP46P62068 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP46P62068 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP46P62068 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP46P62068 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
USP46P62068 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP46P62068 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
USP46P62068 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
USP46P62068 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP46P62068 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP46P62068 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP46P62068 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP46P62068 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP46P62068 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP46P62068 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP46P62068 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP46P62068 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP46P62068 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP46P62068 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP46P62068 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP46P62068 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP46P62068 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms