Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CACNA2D1P54289 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CACNA2D1P54289 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CACNA2D1P54289 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CACNA2D1P54289 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CACNA2D1P54289 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CACNA2D1P54289 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CACNA2D1P54289 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CACNA2D1P54289 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CACNA2D1P54289 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CACNA2D1P54289 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CACNA2D1P54289 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CACNA2D1P54289 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CACNA2D1P54289 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CACNA2D1P54289 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CACNA2D1P54289 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNA2D1P54289 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNA2D1P54289 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA2D1P54289 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA2D1P54289 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNA2D1P54289 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNA2D1P54289 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNA2D1P54289 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNA2D1P54289 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNA2D1P54289 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNA2D1P54289 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNA2D1P54289 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNA2D1P54289 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNA2D1P54289 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNA2D1P54289 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNA2D1P54289 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNA2D1P54289 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNA2D1P54289 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNA2D1P54289 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNA2D1P54289 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNA2D1P54289 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA2D1P54289 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA2D1P54289 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA2D1P54289 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA2D1P54289 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNA2D1P54289 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNA2D1P54289 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNA2D1P54289 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CACNA2D1P54289 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNA2D1P54289 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNA2D1P54289 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNA2D1P54289 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNA2D1P54289 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNA2D1P54289 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNA2D1P54289 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNA2D1P54289 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNA2D1P54289 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNA2D1P54289 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNA2D1P54289 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNA2D1P54289 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNA2D1P54289 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNA2D1P54289 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNA2D1P54289 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNA2D1P54289 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNA2D1P54289 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNA2D1P54289 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNA2D1P54289 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNA2D1P54289 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNA2D1P54289 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNA2D1P54289 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNA2D1P54289 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNA2D1P54289 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNA2D1P54289 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNA2D1P54289 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNA2D1P54289 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNA2D1P54289 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNA2D1P54289 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNA2D1P54289 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNA2D1P54289 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNA2D1P54289 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNA2D1P54289 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNA2D1P54289 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNA2D1P54289 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNA2D1P54289 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNA2D1P54289 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNA2D1P54289 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNA2D1P54289 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNA2D1P54289 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNA2D1P54289 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNA2D1P54289 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNA2D1P54289 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNA2D1P54289 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNA2D1P54289 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNA2D1P54289 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNA2D1P54289 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNA2D1P54289 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNA2D1P54289 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNA2D1P54289 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNA2D1P54289 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNA2D1P54289 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNA2D1P54289 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNA2D1P54289 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNA2D1P54289 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNA2D1P54289 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNA2D1P54289 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms