Protein–RNA interactions for Protein: P53044

UFD1, Ubiquitin fusion degradation protein 1, yeastyeast

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFD1P53044 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.39□□□□□ -1.23
UFD1P53044 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.39□□□□□ -1.23
UFD1P53044 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.39□□□□□ -1.23
UFD1P53044 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.39□□□□□ -1.23
UFD1P53044 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.39□□□□□ -1.23
UFD1P53044 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.39□□□□□ -1.23
UFD1P53044 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.39□□□□□ -1.23
UFD1P53044 YDR467CYDR467C 327 nt7.39□□□□□ -1.23
UFD1P53044 RPN14YGL004C 1254 nt7.39□□□□□ -1.23
UFD1P53044 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt7.39□□□□□ -1.23
UFD1P53044 MHF1YOL086W-A 273 nt7.39□□□□□ -1.23
UFD1P53044 FET5YFL041W 1869 nt7.36□□□□□ -1.23
UFD1P53044 SNU66YOR308C 1764 nt7.36□□□□□ -1.23
UFD1P53044 MAM3YOL060C 2121 nt7.36□□□□□ -1.23
UFD1P53044 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.36□□□□□ -1.23
UFD1P53044 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.36□□□□□ -1.23
UFD1P53044 ESS1YJR017C 513 nt7.36□□□□□ -1.23
UFD1P53044 SWT21YNL187W 1074 nt7.36□□□□□ -1.23
UFD1P53044 YNL190WYNL190W 615 nt7.36□□□□□ -1.23
UFD1P53044 HBS1YKR084C 1836 nt7.36□□□□□ -1.23
UFD1P53044 NPP2YEL016C 1482 nt7.36□□□□□ -1.23
UFD1P53044 POT1YIL160C 1254 nt7.34□□□□□ -1.23
UFD1P53044 ABZ2YMR289W 1125 nt7.34□□□□□ -1.23
UFD1P53044 CRC1YOR100C 984 nt7.34□□□□□ -1.23
UFD1P53044 snR31snR31 225 nt7.34□□□□□ -1.23
UFD1P53044 MET1YKR069W 1782 nt7.32□□□□□ -1.24
UFD1P53044 AMF1YOR378W 1548 nt7.32□□□□□ -1.24
UFD1P53044 LAS17YOR181W 1902 nt7.31□□□□□ -1.24
UFD1P53044 STP3YLR375W 1032 nt7.3□□□□□ -1.24
UFD1P53044 GSF2YML048W 1212 nt7.3□□□□□ -1.24
UFD1P53044 NDE1YMR145C 1683 nt7.3□□□□□ -1.24
UFD1P53044 YBL095WYBL095W 813 nt7.29□□□□□ -1.24
UFD1P53044 ORT1YOR130C 879 nt7.29□□□□□ -1.24
UFD1P53044 PAU5YFL020C 369 nt7.28□□□□□ -1.24
UFD1P53044 ENO2YHR174W 1314 nt7.27□□□□□ -1.24
UFD1P53044 TRP2YER090W 1524 nt7.27□□□□□ -1.25
UFD1P53044 FRT1YOR324C 1809 nt7.27□□□□□ -1.25
UFD1P53044 YKL053WYKL053W 375 nt7.27□□□□□ -1.25
UFD1P53044 GPM1YKL152C 744 nt7.27□□□□□ -1.25
UFD1P53044 NAP1YKR048C 1254 nt7.27□□□□□ -1.25
UFD1P53044 PMA2YPL036W 2844 nt7.26□□□□□ -1.25
UFD1P53044 KGD2YDR148C 1392 nt7.26□□□□□ -1.25
UFD1P53044 HXT11YOL156W 1704 nt7.26□□□□□ -1.25
UFD1P53044 NIF3YGL221C 867 nt7.25□□□□□ -1.25
UFD1P53044 PGC1YPL206C 966 nt7.25□□□□□ -1.25
UFD1P53044 TUB4YLR212C 1422 nt7.24□□□□□ -1.25
UFD1P53044 BEM1YBR200W 1656 nt7.23□□□□□ -1.25
UFD1P53044 SAN1YDR143C 1833 nt7.23□□□□□ -1.25
UFD1P53044 PAR32YDL173W 888 nt7.23□□□□□ -1.25
UFD1P53044 TPC1YGR096W 945 nt7.23□□□□□ -1.25
UFD1P53044 SEN2YLR105C 1134 nt7.23□□□□□ -1.25
UFD1P53044 YBR232CYBR232C 360 nt7.23□□□□□ -1.25
UFD1P53044 AAT1YKL106W 1356 nt7.22□□□□□ -1.25
UFD1P53044 EMC3YKL207W 762 nt7.22□□□□□ -1.25
UFD1P53044 YMC2YBR104W 990 nt7.22□□□□□ -1.25
UFD1P53044 LEU2YCL018W 1095 nt7.22□□□□□ -1.25
UFD1P53044 APS2YJR058C 444 nt7.21□□□□□ -1.26
UFD1P53044 GNP1YDR508C 1992 nt7.2□□□□□ -1.26
UFD1P53044 THI3YDL080C 1830 nt7.2□□□□□ -1.26
UFD1P53044 GGC1YDL198C 903 nt7.2□□□□□ -1.26
UFD1P53044 CCR4YAL021C 2514 nt7.19□□□□□ -1.26
UFD1P53044 DUS3YLR401C 2007 nt7.19□□□□□ -1.26
UFD1P53044 GGA2YHR108W 1758 nt7.19□□□□□ -1.26
UFD1P53044 SBP1YHL034C 885 nt7.19□□□□□ -1.26
UFD1P53044 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.19□□□□□ -1.26
UFD1P53044 snR4snR4 186 nt7.19□□□□□ -1.26
UFD1P53044 NAM8YHR086W 1572 nt7.19□□□□□ -1.26
UFD1P53044 KRE1YNL322C 942 nt7.18□□□□□ -1.26
UFD1P53044 SRP54YPR088C 1626 nt7.18□□□□□ -1.26
UFD1P53044 CTF3YLR381W 2202 nt7.17□□□□□ -1.26
UFD1P53044 ADE16YLR028C 1776 nt7.17□□□□□ -1.26
UFD1P53044 YMR210WYMR210W 1350 nt7.17□□□□□ -1.26
UFD1P53044 SRM1YGL097W 1449 nt7.17□□□□□ -1.26
UFD1P53044 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.16□□□□□ -1.26
UFD1P53044 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.16□□□□□ -1.26
UFD1P53044 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.16□□□□□ -1.26
UFD1P53044 NAS2YIL007C 663 nt7.15□□□□□ -1.26
UFD1P53044 REX2YLR059C 810 nt7.15□□□□□ -1.26
UFD1P53044 POP2YNR052C 1302 nt7.15□□□□□ -1.26
UFD1P53044 THP3YPR045C 1413 nt7.15□□□□□ -1.27
UFD1P53044 MRS4YKR052C 915 nt7.14□□□□□ -1.27
UFD1P53044 CDD1YLR245C 429 nt7.14□□□□□ -1.27
UFD1P53044 FSH2YMR222C 672 nt7.14□□□□□ -1.27
UFD1P53044 SPE2YOL052C 1191 nt7.14□□□□□ -1.27
UFD1P53044 DIA4YHR011W 1341 nt7.13□□□□□ -1.27
UFD1P53044 YLR072WYLR072W 2082 nt7.13□□□□□ -1.27
UFD1P53044 YJL064WYJL064W 396 nt7.12□□□□□ -1.27
UFD1P53044 GAS1YMR307W 1680 nt7.12□□□□□ -1.27
UFD1P53044 YEL023CYEL023C 2049 nt7.1□□□□□ -1.27
UFD1P53044 PTC6YCR079W 1329 nt7.1□□□□□ -1.27
UFD1P53044 PAU19YMR325W 375 nt7.1□□□□□ -1.27
UFD1P53044 YPT11YNL304W 1254 nt7.1□□□□□ -1.27
UFD1P53044 AAC3YBR085W 924 nt7.1□□□□□ -1.27
UFD1P53044 FTH1YBR207W 1398 nt7.09□□□□□ -1.27
UFD1P53044 YIL108WYIL108W 2091 nt7.08□□□□□ -1.28
UFD1P53044 MAS1YLR163C 1389 nt7.08□□□□□ -1.28
UFD1P53044 AIM34YMR003W 597 nt7.08□□□□□ -1.28
UFD1P53044 PUP1YOR157C 786 nt7.08□□□□□ -1.28
UFD1P53044 LEA1YPL213W 717 nt7.08□□□□□ -1.28
UFD1P53044 snR86snR86 1004 nt7.07□□□□□ -1.28
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