Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC1A2P43004 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC1A2P43004 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC1A2P43004 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC1A2P43004 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC1A2P43004 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC1A2P43004 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC1A2P43004 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC1A2P43004 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC1A2P43004 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC1A2P43004 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC1A2P43004 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC1A2P43004 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC1A2P43004 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC1A2P43004 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC1A2P43004 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC1A2P43004 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC1A2P43004 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC1A2P43004 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC1A2P43004 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC1A2P43004 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC1A2P43004 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC1A2P43004 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A2P43004 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A2P43004 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A2P43004 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC1A2P43004 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC1A2P43004 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC1A2P43004 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC1A2P43004 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC1A2P43004 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC1A2P43004 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC1A2P43004 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC1A2P43004 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC1A2P43004 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A2P43004 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A2P43004 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A2P43004 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A2P43004 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A2P43004 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC1A2P43004 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC1A2P43004 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC1A2P43004 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC1A2P43004 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC1A2P43004 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC1A2P43004 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC1A2P43004 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC1A2P43004 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC1A2P43004 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC1A2P43004 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC1A2P43004 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC1A2P43004 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC1A2P43004 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC1A2P43004 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC1A2P43004 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC1A2P43004 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC1A2P43004 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC1A2P43004 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC1A2P43004 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC1A2P43004 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC1A2P43004 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC1A2P43004 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC1A2P43004 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC1A2P43004 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC1A2P43004 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC1A2P43004 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC1A2P43004 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC1A2P43004 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC1A2P43004 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC1A2P43004 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC1A2P43004 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC1A2P43004 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC1A2P43004 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC1A2P43004 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC1A2P43004 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC1A2P43004 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC1A2P43004 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC1A2P43004 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC1A2P43004 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC1A2P43004 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC1A2P43004 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC1A2P43004 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC1A2P43004 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC1A2P43004 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC1A2P43004 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC1A2P43004 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC1A2P43004 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC1A2P43004 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC1A2P43004 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC1A2P43004 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC1A2P43004 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC1A2P43004 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC1A2P43004 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC1A2P43004 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC1A2P43004 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC1A2P43004 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC1A2P43004 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC1A2P43004 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC1A2P43004 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC1A2P43004 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms