Protein–RNA interactions for Protein: P32242

OTX1, Homeobox protein OTX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1P32242 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTX1P32242 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTX1P32242 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTX1P32242 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTX1P32242 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTX1P32242 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTX1P32242 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTX1P32242 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTX1P32242 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTX1P32242 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTX1P32242 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTX1P32242 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTX1P32242 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
OTX1P32242 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTX1P32242 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTX1P32242 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTX1P32242 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTX1P32242 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTX1P32242 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTX1P32242 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTX1P32242 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTX1P32242 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
OTX1P32242 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTX1P32242 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTX1P32242 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTX1P32242 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTX1P32242 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
OTX1P32242 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTX1P32242 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTX1P32242 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTX1P32242 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
OTX1P32242 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTX1P32242 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTX1P32242 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTX1P32242 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTX1P32242 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTX1P32242 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
OTX1P32242 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTX1P32242 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTX1P32242 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTX1P32242 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTX1P32242 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTX1P32242 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTX1P32242 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTX1P32242 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTX1P32242 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTX1P32242 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTX1P32242 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTX1P32242 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTX1P32242 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTX1P32242 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTX1P32242 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTX1P32242 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
OTX1P32242 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTX1P32242 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTX1P32242 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTX1P32242 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTX1P32242 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
OTX1P32242 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTX1P32242 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTX1P32242 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTX1P32242 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTX1P32242 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTX1P32242 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTX1P32242 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTX1P32242 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTX1P32242 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTX1P32242 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTX1P32242 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTX1P32242 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTX1P32242 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
OTX1P32242 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTX1P32242 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTX1P32242 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTX1P32242 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTX1P32242 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTX1P32242 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTX1P32242 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTX1P32242 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OTX1P32242 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTX1P32242 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTX1P32242 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTX1P32242 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTX1P32242 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTX1P32242 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTX1P32242 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTX1P32242 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
OTX1P32242 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
OTX1P32242 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTX1P32242 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTX1P32242 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTX1P32242 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTX1P32242 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTX1P32242 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTX1P32242 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTX1P32242 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTX1P32242 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTX1P32242 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTX1P32242 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
OTX1P32242 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms