Protein–RNA interactions for Protein: P30549

Tacr2, Substance-K receptor, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr2P30549 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tacr2P30549 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tacr2P30549 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tacr2P30549 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tacr2P30549 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tacr2P30549 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tacr2P30549 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tacr2P30549 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tacr2P30549 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tacr2P30549 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tacr2P30549 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tacr2P30549 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tacr2P30549 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tacr2P30549 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tacr2P30549 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tacr2P30549 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tacr2P30549 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tacr2P30549 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tacr2P30549 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tacr2P30549 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tacr2P30549 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tacr2P30549 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tacr2P30549 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tacr2P30549 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tacr2P30549 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tacr2P30549 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tacr2P30549 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tacr2P30549 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tacr2P30549 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tacr2P30549 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tacr2P30549 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tacr2P30549 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tacr2P30549 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tacr2P30549 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tacr2P30549 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tacr2P30549 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tacr2P30549 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tacr2P30549 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tacr2P30549 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tacr2P30549 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tacr2P30549 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tacr2P30549 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tacr2P30549 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tacr2P30549 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tacr2P30549 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tacr2P30549 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tacr2P30549 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tacr2P30549 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tacr2P30549 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tacr2P30549 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tacr2P30549 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tacr2P30549 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tacr2P30549 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tacr2P30549 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tacr2P30549 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tacr2P30549 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tacr2P30549 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tacr2P30549 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tacr2P30549 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tacr2P30549 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tacr2P30549 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tacr2P30549 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tacr2P30549 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tacr2P30549 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tacr2P30549 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tacr2P30549 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tacr2P30549 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tacr2P30549 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tacr2P30549 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tacr2P30549 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tacr2P30549 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tacr2P30549 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tacr2P30549 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tacr2P30549 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tacr2P30549 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tacr2P30549 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tacr2P30549 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tacr2P30549 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tacr2P30549 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tacr2P30549 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tacr2P30549 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tacr2P30549 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tacr2P30549 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tacr2P30549 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tacr2P30549 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tacr2P30549 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tacr2P30549 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tacr2P30549 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tacr2P30549 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tacr2P30549 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tacr2P30549 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tacr2P30549 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tacr2P30549 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tacr2P30549 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tacr2P30549 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tacr2P30549 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tacr2P30549 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tacr2P30549 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tacr2P30549 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tacr2P30549 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms