Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
KDM5AP29375 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.68
KDM5AP29375 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
KDM5AP29375 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
KDM5AP29375 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
KDM5AP29375 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
KDM5AP29375 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
KDM5AP29375 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
KDM5AP29375 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
KDM5AP29375 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
KDM5AP29375 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
KDM5AP29375 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
KDM5AP29375 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
KDM5AP29375 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
KDM5AP29375 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
KDM5AP29375 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
KDM5AP29375 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
KDM5AP29375 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
KDM5AP29375 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
KDM5AP29375 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
KDM5AP29375 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
KDM5AP29375 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
KDM5AP29375 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
KDM5AP29375 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
KDM5AP29375 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
KDM5AP29375 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
KDM5AP29375 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
KDM5AP29375 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
KDM5AP29375 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
KDM5AP29375 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
KDM5AP29375 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
KDM5AP29375 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
KDM5AP29375 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
KDM5AP29375 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
KDM5AP29375 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
KDM5AP29375 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
KDM5AP29375 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC37.88■■■■□ 3.66
KDM5AP29375 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
KDM5AP29375 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
KDM5AP29375 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
KDM5AP29375 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
KDM5AP29375 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
KDM5AP29375 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
KDM5AP29375 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
KDM5AP29375 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
KDM5AP29375 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
KDM5AP29375 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
KDM5AP29375 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
KDM5AP29375 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
KDM5AP29375 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
KDM5AP29375 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
KDM5AP29375 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.65
KDM5AP29375 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
KDM5AP29375 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
KDM5AP29375 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
KDM5AP29375 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
KDM5AP29375 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
KDM5AP29375 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
KDM5AP29375 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
KDM5AP29375 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
KDM5AP29375 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
KDM5AP29375 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
KDM5AP29375 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
KDM5AP29375 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
KDM5AP29375 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
KDM5AP29375 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
KDM5AP29375 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.75■■■■□ 3.63
KDM5AP29375 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
KDM5AP29375 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
KDM5AP29375 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
KDM5AP29375 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
KDM5AP29375 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
KDM5AP29375 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC37.71■■■■□ 3.63
KDM5AP29375 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
KDM5AP29375 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
KDM5AP29375 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
KDM5AP29375 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
KDM5AP29375 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
KDM5AP29375 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
KDM5AP29375 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
KDM5AP29375 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
KDM5AP29375 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
KDM5AP29375 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
KDM5AP29375 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
KDM5AP29375 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
KDM5AP29375 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
KDM5AP29375 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
KDM5AP29375 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.62
KDM5AP29375 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
KDM5AP29375 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
KDM5AP29375 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
KDM5AP29375 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
KDM5AP29375 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
KDM5AP29375 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
KDM5AP29375 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
KDM5AP29375 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
KDM5AP29375 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
KDM5AP29375 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
KDM5AP29375 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
KDM5AP29375 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms