Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MARK3P27448 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MARK3P27448 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
MARK3P27448 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MARK3P27448 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
MARK3P27448 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
MARK3P27448 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
MARK3P27448 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
MARK3P27448 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
MARK3P27448 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
MARK3P27448 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
MARK3P27448 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
MARK3P27448 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
MARK3P27448 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MARK3P27448 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MARK3P27448 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MARK3P27448 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MARK3P27448 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MARK3P27448 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MARK3P27448 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MARK3P27448 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MARK3P27448 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MARK3P27448 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MARK3P27448 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
MARK3P27448 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MARK3P27448 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MARK3P27448 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MARK3P27448 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MARK3P27448 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
MARK3P27448 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MARK3P27448 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MARK3P27448 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MARK3P27448 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MARK3P27448 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MARK3P27448 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MARK3P27448 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MARK3P27448 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MARK3P27448 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MARK3P27448 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
MARK3P27448 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MARK3P27448 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MARK3P27448 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MARK3P27448 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MARK3P27448 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MARK3P27448 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MARK3P27448 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MARK3P27448 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MARK3P27448 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MARK3P27448 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MARK3P27448 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MARK3P27448 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MARK3P27448 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MARK3P27448 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MARK3P27448 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MARK3P27448 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MARK3P27448 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MARK3P27448 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MARK3P27448 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MARK3P27448 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MARK3P27448 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MARK3P27448 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MARK3P27448 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MARK3P27448 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MARK3P27448 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MARK3P27448 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MARK3P27448 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MARK3P27448 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
MARK3P27448 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MARK3P27448 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
MARK3P27448 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MARK3P27448 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MARK3P27448 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MARK3P27448 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MARK3P27448 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MARK3P27448 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MARK3P27448 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MARK3P27448 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MARK3P27448 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MARK3P27448 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MARK3P27448 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MARK3P27448 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MARK3P27448 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
MARK3P27448 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MARK3P27448 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MARK3P27448 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MARK3P27448 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MARK3P27448 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MARK3P27448 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MARK3P27448 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MARK3P27448 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MARK3P27448 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MARK3P27448 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MARK3P27448 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MARK3P27448 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MARK3P27448 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
MARK3P27448 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MARK3P27448 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MARK3P27448 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MARK3P27448 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MARK3P27448 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms