Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CHMLP26374 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CHMLP26374 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CHMLP26374 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CHMLP26374 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CHMLP26374 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CHMLP26374 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CHMLP26374 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CHMLP26374 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CHMLP26374 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CHMLP26374 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CHMLP26374 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CHMLP26374 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CHMLP26374 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CHMLP26374 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CHMLP26374 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CHMLP26374 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CHMLP26374 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CHMLP26374 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CHMLP26374 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CHMLP26374 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CHMLP26374 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CHMLP26374 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CHMLP26374 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CHMLP26374 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CHMLP26374 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CHMLP26374 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CHMLP26374 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CHMLP26374 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CHMLP26374 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CHMLP26374 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CHMLP26374 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CHMLP26374 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
CHMLP26374 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CHMLP26374 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
CHMLP26374 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CHMLP26374 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
CHMLP26374 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CHMLP26374 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CHMLP26374 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CHMLP26374 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
CHMLP26374 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CHMLP26374 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CHMLP26374 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CHMLP26374 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
CHMLP26374 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CHMLP26374 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CHMLP26374 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CHMLP26374 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHMLP26374 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHMLP26374 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHMLP26374 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHMLP26374 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHMLP26374 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHMLP26374 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHMLP26374 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHMLP26374 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CHMLP26374 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CHMLP26374 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CHMLP26374 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CHMLP26374 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CHMLP26374 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CHMLP26374 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CHMLP26374 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CHMLP26374 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CHMLP26374 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CHMLP26374 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CHMLP26374 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CHMLP26374 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CHMLP26374 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CHMLP26374 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
CHMLP26374 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CHMLP26374 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CHMLP26374 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CHMLP26374 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CHMLP26374 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CHMLP26374 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CHMLP26374 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CHMLP26374 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHMLP26374 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHMLP26374 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHMLP26374 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CHMLP26374 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CHMLP26374 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CHMLP26374 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CHMLP26374 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CHMLP26374 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHMLP26374 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHMLP26374 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHMLP26374 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHMLP26374 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHMLP26374 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CHMLP26374 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CHMLP26374 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CHMLP26374 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CHMLP26374 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CHMLP26374 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CHMLP26374 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CHMLP26374 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CHMLP26374 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 863.9 ms