Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RARGP13631 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RARGP13631 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RARGP13631 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RARGP13631 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RARGP13631 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RARGP13631 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RARGP13631 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RARGP13631 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RARGP13631 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RARGP13631 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RARGP13631 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RARGP13631 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RARGP13631 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RARGP13631 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RARGP13631 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RARGP13631 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RARGP13631 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.51■■■□□ 2
RARGP13631 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RARGP13631 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RARGP13631 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RARGP13631 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RARGP13631 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RARGP13631 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RARGP13631 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RARGP13631 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RARGP13631 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RARGP13631 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RARGP13631 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RARGP13631 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RARGP13631 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RARGP13631 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RARGP13631 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RARGP13631 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RARGP13631 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RARGP13631 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RARGP13631 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RARGP13631 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RARGP13631 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RARGP13631 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RARGP13631 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RARGP13631 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RARGP13631 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RARGP13631 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RARGP13631 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RARGP13631 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RARGP13631 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RARGP13631 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RARGP13631 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RARGP13631 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RARGP13631 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RARGP13631 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RARGP13631 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RARGP13631 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RARGP13631 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RARGP13631 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RARGP13631 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RARGP13631 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RARGP13631 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RARGP13631 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RARGP13631 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RARGP13631 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RARGP13631 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RARGP13631 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RARGP13631 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RARGP13631 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RARGP13631 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RARGP13631 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RARGP13631 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RARGP13631 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RARGP13631 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RARGP13631 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RARGP13631 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RARGP13631 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RARGP13631 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RARGP13631 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RARGP13631 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RARGP13631 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RARGP13631 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RARGP13631 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RARGP13631 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RARGP13631 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RARGP13631 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RARGP13631 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RARGP13631 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RARGP13631 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RARGP13631 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RARGP13631 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RARGP13631 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RARGP13631 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RARGP13631 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RARGP13631 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RARGP13631 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RARGP13631 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RARGP13631 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RARGP13631 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RARGP13631 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RARGP13631 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RARGP13631 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RARGP13631 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms