Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYP2C9P11712 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYP2C9P11712 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYP2C9P11712 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYP2C9P11712 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYP2C9P11712 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYP2C9P11712 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYP2C9P11712 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYP2C9P11712 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYP2C9P11712 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CYP2C9P11712 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CYP2C9P11712 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CYP2C9P11712 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CYP2C9P11712 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CYP2C9P11712 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CYP2C9P11712 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CYP2C9P11712 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CYP2C9P11712 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CYP2C9P11712 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CYP2C9P11712 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CYP2C9P11712 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CYP2C9P11712 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CYP2C9P11712 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CYP2C9P11712 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CYP2C9P11712 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CYP2C9P11712 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CYP2C9P11712 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CYP2C9P11712 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CYP2C9P11712 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CYP2C9P11712 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CYP2C9P11712 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CYP2C9P11712 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CYP2C9P11712 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CYP2C9P11712 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CYP2C9P11712 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CYP2C9P11712 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CYP2C9P11712 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CYP2C9P11712 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CYP2C9P11712 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CYP2C9P11712 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CYP2C9P11712 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CYP2C9P11712 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CYP2C9P11712 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CYP2C9P11712 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CYP2C9P11712 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CYP2C9P11712 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CYP2C9P11712 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CYP2C9P11712 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CYP2C9P11712 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CYP2C9P11712 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CYP2C9P11712 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CYP2C9P11712 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CYP2C9P11712 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CYP2C9P11712 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CYP2C9P11712 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CYP2C9P11712 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CYP2C9P11712 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CYP2C9P11712 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CYP2C9P11712 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CYP2C9P11712 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CYP2C9P11712 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CYP2C9P11712 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CYP2C9P11712 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CYP2C9P11712 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CYP2C9P11712 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CYP2C9P11712 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CYP2C9P11712 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CYP2C9P11712 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CYP2C9P11712 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CYP2C9P11712 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CYP2C9P11712 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CYP2C9P11712 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYP2C9P11712 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYP2C9P11712 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYP2C9P11712 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CYP2C9P11712 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CYP2C9P11712 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CYP2C9P11712 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CYP2C9P11712 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CYP2C9P11712 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYP2C9P11712 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYP2C9P11712 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYP2C9P11712 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYP2C9P11712 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYP2C9P11712 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP2C9P11712 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP2C9P11712 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP2C9P11712 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP2C9P11712 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP2C9P11712 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CYP2C9P11712 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CYP2C9P11712 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CYP2C9P11712 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CYP2C9P11712 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYP2C9P11712 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CYP2C9P11712 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CYP2C9P11712 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CYP2C9P11712 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CYP2C9P11712 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CYP2C9P11712 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms