Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RALAP11233 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RALAP11233 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RALAP11233 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RALAP11233 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RALAP11233 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RALAP11233 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
RALAP11233 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RALAP11233 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RALAP11233 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RALAP11233 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RALAP11233 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RALAP11233 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RALAP11233 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RALAP11233 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RALAP11233 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RALAP11233 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RALAP11233 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RALAP11233 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RALAP11233 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RALAP11233 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RALAP11233 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RALAP11233 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RALAP11233 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RALAP11233 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RALAP11233 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RALAP11233 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RALAP11233 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RALAP11233 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RALAP11233 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RALAP11233 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RALAP11233 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RALAP11233 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RALAP11233 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RALAP11233 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RALAP11233 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RALAP11233 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RALAP11233 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RALAP11233 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RALAP11233 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RALAP11233 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RALAP11233 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RALAP11233 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RALAP11233 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RALAP11233 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RALAP11233 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RALAP11233 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RALAP11233 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RALAP11233 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RALAP11233 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RALAP11233 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RALAP11233 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RALAP11233 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RALAP11233 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RALAP11233 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RALAP11233 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RALAP11233 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RALAP11233 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RALAP11233 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RALAP11233 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RALAP11233 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RALAP11233 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RALAP11233 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RALAP11233 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RALAP11233 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RALAP11233 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RALAP11233 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RALAP11233 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RALAP11233 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RALAP11233 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RALAP11233 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RALAP11233 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RALAP11233 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RALAP11233 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RALAP11233 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RALAP11233 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RALAP11233 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RALAP11233 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RALAP11233 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RALAP11233 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RALAP11233 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RALAP11233 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RALAP11233 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RALAP11233 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RALAP11233 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RALAP11233 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RALAP11233 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RALAP11233 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RALAP11233 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RALAP11233 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RALAP11233 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RALAP11233 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RALAP11233 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RALAP11233 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RALAP11233 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RALAP11233 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RALAP11233 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RALAP11233 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RALAP11233 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RALAP11233 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms