Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKHD1P08F94 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKHD1P08F94 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKHD1P08F94 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKHD1P08F94 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKHD1P08F94 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKHD1P08F94 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PKHD1P08F94 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PKHD1P08F94 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKHD1P08F94 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PKHD1P08F94 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKHD1P08F94 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKHD1P08F94 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKHD1P08F94 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKHD1P08F94 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKHD1P08F94 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKHD1P08F94 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKHD1P08F94 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKHD1P08F94 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PKHD1P08F94 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKHD1P08F94 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKHD1P08F94 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PKHD1P08F94 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKHD1P08F94 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKHD1P08F94 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKHD1P08F94 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKHD1P08F94 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKHD1P08F94 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKHD1P08F94 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKHD1P08F94 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PKHD1P08F94 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKHD1P08F94 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKHD1P08F94 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKHD1P08F94 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PKHD1P08F94 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKHD1P08F94 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKHD1P08F94 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKHD1P08F94 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PKHD1P08F94 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKHD1P08F94 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PKHD1P08F94 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKHD1P08F94 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKHD1P08F94 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKHD1P08F94 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKHD1P08F94 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKHD1P08F94 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKHD1P08F94 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKHD1P08F94 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PKHD1P08F94 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKHD1P08F94 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKHD1P08F94 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PKHD1P08F94 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKHD1P08F94 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PKHD1P08F94 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PKHD1P08F94 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKHD1P08F94 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKHD1P08F94 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKHD1P08F94 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKHD1P08F94 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKHD1P08F94 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKHD1P08F94 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKHD1P08F94 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKHD1P08F94 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PKHD1P08F94 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PKHD1P08F94 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKHD1P08F94 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKHD1P08F94 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PKHD1P08F94 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKHD1P08F94 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKHD1P08F94 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKHD1P08F94 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKHD1P08F94 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKHD1P08F94 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKHD1P08F94 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKHD1P08F94 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKHD1P08F94 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PKHD1P08F94 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PKHD1P08F94 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PKHD1P08F94 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PKHD1P08F94 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PKHD1P08F94 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PKHD1P08F94 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PKHD1P08F94 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PKHD1P08F94 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PKHD1P08F94 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PKHD1P08F94 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PKHD1P08F94 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKHD1P08F94 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKHD1P08F94 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKHD1P08F94 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PKHD1P08F94 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKHD1P08F94 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKHD1P08F94 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKHD1P08F94 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKHD1P08F94 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKHD1P08F94 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKHD1P08F94 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PKHD1P08F94 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PKHD1P08F94 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PKHD1P08F94 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms