Protein–RNA interactions for Protein: O60925

PFDN1, Prefoldin subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN1O60925 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PFDN1O60925 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PFDN1O60925 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PFDN1O60925 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PFDN1O60925 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PFDN1O60925 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PFDN1O60925 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PFDN1O60925 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PFDN1O60925 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PFDN1O60925 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PFDN1O60925 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PFDN1O60925 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PFDN1O60925 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFDN1O60925 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFDN1O60925 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFDN1O60925 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PFDN1O60925 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFDN1O60925 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PFDN1O60925 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFDN1O60925 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFDN1O60925 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFDN1O60925 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFDN1O60925 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFDN1O60925 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFDN1O60925 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFDN1O60925 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFDN1O60925 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFDN1O60925 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFDN1O60925 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFDN1O60925 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PFDN1O60925 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PFDN1O60925 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PFDN1O60925 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PFDN1O60925 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PFDN1O60925 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PFDN1O60925 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PFDN1O60925 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PFDN1O60925 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PFDN1O60925 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PFDN1O60925 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PFDN1O60925 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PFDN1O60925 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PFDN1O60925 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PFDN1O60925 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PFDN1O60925 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PFDN1O60925 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PFDN1O60925 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFDN1O60925 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFDN1O60925 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PFDN1O60925 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PFDN1O60925 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PFDN1O60925 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PFDN1O60925 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFDN1O60925 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFDN1O60925 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFDN1O60925 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFDN1O60925 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFDN1O60925 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFDN1O60925 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFDN1O60925 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFDN1O60925 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFDN1O60925 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PFDN1O60925 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PFDN1O60925 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PFDN1O60925 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PFDN1O60925 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PFDN1O60925 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PFDN1O60925 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PFDN1O60925 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PFDN1O60925 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PFDN1O60925 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PFDN1O60925 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PFDN1O60925 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PFDN1O60925 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PFDN1O60925 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PFDN1O60925 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PFDN1O60925 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PFDN1O60925 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PFDN1O60925 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PFDN1O60925 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PFDN1O60925 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PFDN1O60925 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PFDN1O60925 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PFDN1O60925 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PFDN1O60925 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PFDN1O60925 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PFDN1O60925 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PFDN1O60925 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PFDN1O60925 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PFDN1O60925 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PFDN1O60925 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PFDN1O60925 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PFDN1O60925 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PFDN1O60925 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFDN1O60925 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFDN1O60925 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PFDN1O60925 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFDN1O60925 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFDN1O60925 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFDN1O60925 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms