Protein–RNA interactions for Protein: O43759

SYNGR1, Synaptogyrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR1O43759 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNGR1O43759 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNGR1O43759 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNGR1O43759 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNGR1O43759 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNGR1O43759 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNGR1O43759 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNGR1O43759 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNGR1O43759 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNGR1O43759 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNGR1O43759 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYNGR1O43759 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYNGR1O43759 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGR1O43759 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGR1O43759 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNGR1O43759 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNGR1O43759 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGR1O43759 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGR1O43759 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGR1O43759 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNGR1O43759 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNGR1O43759 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNGR1O43759 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNGR1O43759 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNGR1O43759 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNGR1O43759 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNGR1O43759 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNGR1O43759 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNGR1O43759 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNGR1O43759 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNGR1O43759 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNGR1O43759 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNGR1O43759 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNGR1O43759 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNGR1O43759 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGR1O43759 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGR1O43759 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGR1O43759 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGR1O43759 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNGR1O43759 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNGR1O43759 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNGR1O43759 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNGR1O43759 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNGR1O43759 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNGR1O43759 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNGR1O43759 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNGR1O43759 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNGR1O43759 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNGR1O43759 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNGR1O43759 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNGR1O43759 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNGR1O43759 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNGR1O43759 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNGR1O43759 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNGR1O43759 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYNGR1O43759 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGR1O43759 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNGR1O43759 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNGR1O43759 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNGR1O43759 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNGR1O43759 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNGR1O43759 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNGR1O43759 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms