Protein–RNA interactions for Protein: O15258

RER1, Protein RER1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RER1O15258 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RER1O15258 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RER1O15258 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RER1O15258 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RER1O15258 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RER1O15258 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RER1O15258 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RER1O15258 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RER1O15258 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RER1O15258 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RER1O15258 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RER1O15258 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RER1O15258 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RER1O15258 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RER1O15258 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RER1O15258 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RER1O15258 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RER1O15258 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RER1O15258 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RER1O15258 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RER1O15258 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RER1O15258 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RER1O15258 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RER1O15258 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RER1O15258 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RER1O15258 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RER1O15258 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RER1O15258 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RER1O15258 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RER1O15258 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RER1O15258 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RER1O15258 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RER1O15258 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RER1O15258 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RER1O15258 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RER1O15258 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RER1O15258 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RER1O15258 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RER1O15258 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RER1O15258 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RER1O15258 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RER1O15258 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RER1O15258 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RER1O15258 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RER1O15258 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RER1O15258 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RER1O15258 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RER1O15258 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RER1O15258 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RER1O15258 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RER1O15258 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RER1O15258 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RER1O15258 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RER1O15258 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RER1O15258 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RER1O15258 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RER1O15258 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RER1O15258 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RER1O15258 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RER1O15258 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RER1O15258 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RER1O15258 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RER1O15258 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RER1O15258 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RER1O15258 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RER1O15258 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RER1O15258 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RER1O15258 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RER1O15258 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RER1O15258 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RER1O15258 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RER1O15258 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RER1O15258 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RER1O15258 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RER1O15258 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RER1O15258 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RER1O15258 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RER1O15258 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RER1O15258 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RER1O15258 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RER1O15258 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RER1O15258 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RER1O15258 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RER1O15258 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RER1O15258 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RER1O15258 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RER1O15258 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RER1O15258 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RER1O15258 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RER1O15258 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RER1O15258 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RER1O15258 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RER1O15258 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RER1O15258 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RER1O15258 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RER1O15258 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RER1O15258 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RER1O15258 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RER1O15258 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RER1O15258 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms