Protein–RNA interactions for Protein: O13559

YRF1-4, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 4, yeastyeast

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Length 1,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-4O13559 YJL160CYJL160C 864 nt10.78□□□□□ -0.68
YRF1-4O13559 DLD3YEL071W 1491 nt10.78□□□□□ -0.68
YRF1-4O13559 SDS24YBR214W 1584 nt10.77□□□□□ -0.69
YRF1-4O13559 SWT21YNL187W 1074 nt10.77□□□□□ -0.69
YRF1-4O13559 MRP1YDR347W 966 nt10.76□□□□□ -0.69
YRF1-4O13559 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt10.76□□□□□ -0.69
YRF1-4O13559 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt10.76□□□□□ -0.69
YRF1-4O13559 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt10.76□□□□□ -0.69
YRF1-4O13559 SUP51tL(UAA)J 84 nt10.76□□□□□ -0.69
YRF1-4O13559 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt10.76□□□□□ -0.69
YRF1-4O13559 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt10.76□□□□□ -0.69
YRF1-4O13559 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt10.76□□□□□ -0.69
YRF1-4O13559 YKL053WYKL053W 375 nt10.76□□□□□ -0.69
YRF1-4O13559 YLR280CYLR280C 351 nt10.75□□□□□ -0.69
YRF1-4O13559 LEU2YCL018W 1095 nt10.75□□□□□ -0.69
YRF1-4O13559 YPL108WYPL108W 507 nt10.74□□□□□ -0.69
YRF1-4O13559 MET1YKR069W 1782 nt10.74□□□□□ -0.69
YRF1-4O13559 YMR209CYMR209C 1374 nt10.73□□□□□ -0.69
YRF1-4O13559 ENO1YGR254W 1314 nt10.72□□□□□ -0.69
YRF1-4O13559 YMR210WYMR210W 1350 nt10.71□□□□□ -0.69
YRF1-4O13559 SUV3YPL029W 2214 nt10.71□□□□□ -0.69
YRF1-4O13559 KEL3YPL263C 1956 nt10.7□□□□□ -0.7
YRF1-4O13559 REX2YLR059C 810 nt10.7□□□□□ -0.7
YRF1-4O13559 YHR219WYHR219W 1875 nt10.7□□□□□ -0.7
YRF1-4O13559 VMA11YPL234C 495 nt10.69□□□□□ -0.7
YRF1-4O13559 CRC1YOR100C 984 nt10.68□□□□□ -0.7
YRF1-4O13559 VBA3YCL069W 1377 nt10.67□□□□□ -0.7
YRF1-4O13559 HAP5YOR358W 729 nt10.65□□□□□ -0.7
YRF1-4O13559 HSL7YBR133C 2484 nt10.65□□□□□ -0.7
YRF1-4O13559 YPL247CYPL247C 1572 nt10.65□□□□□ -0.7
YRF1-4O13559 BAP3YDR046C 1815 nt10.65□□□□□ -0.7
YRF1-4O13559 YMR265CYMR265C 1386 nt10.64□□□□□ -0.71
YRF1-4O13559 RPD3YNL330C 1302 nt10.64□□□□□ -0.71
YRF1-4O13559 ODC1YPL134C 933 nt10.63□□□□□ -0.71
YRF1-4O13559 PET18YCR020C 648 nt10.62□□□□□ -0.71
YRF1-4O13559 PRE5YMR314W 705 nt10.62□□□□□ -0.71
YRF1-4O13559 GDH1YOR375C 1365 nt10.61□□□□□ -0.71
YRF1-4O13559 ADA2YDR448W 1305 nt10.61□□□□□ -0.71
YRF1-4O13559 SNX3YOR357C 489 nt10.61□□□□□ -0.71
YRF1-4O13559 SRP54YPR088C 1626 nt10.61□□□□□ -0.71
YRF1-4O13559 YGL114WYGL114W 2178 nt10.61□□□□□ -0.71
YRF1-4O13559 RIM2YBR192W 1134 nt10.6□□□□□ -0.71
YRF1-4O13559 SDH8YBR269C 417 nt10.59□□□□□ -0.71
YRF1-4O13559 UTR5YEL035C 501 nt10.56□□□□□ -0.72
YRF1-4O13559 SAN1YDR143C 1833 nt10.55□□□□□ -0.72
YRF1-4O13559 KGD2YDR148C 1392 nt10.55□□□□□ -0.72
YRF1-4O13559 ELP4YPL101W 1371 nt10.55□□□□□ -0.72
YRF1-4O13559 ZAP1YJL056C 2643 nt10.55□□□□□ -0.72
YRF1-4O13559 snR31snR31 225 nt10.54□□□□□ -0.72
YRF1-4O13559 SSL2YIL143C 2532 nt10.52□□□□□ -0.73
YRF1-4O13559 RPN14YGL004C 1254 nt10.52□□□□□ -0.73
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YRF1-4O13559 LSP1YPL004C 1026 nt10.5□□□□□ -0.73
YRF1-4O13559 YMR166CYMR166C 1107 nt10.49□□□□□ -0.73
YRF1-4O13559 PSD1YNL169C 1503 nt10.48□□□□□ -0.73
YRF1-4O13559 YJR149WYJR149W 1215 nt10.48□□□□□ -0.73
YRF1-4O13559 RPC31YNL151C 756 nt10.47□□□□□ -0.73
YRF1-4O13559 DMA2YNL116W 1569 nt10.46□□□□□ -0.73
YRF1-4O13559 ADE1YAR015W 921 nt10.46□□□□□ -0.74
YRF1-4O13559 PTC6YCR079W 1329 nt10.46□□□□□ -0.74
YRF1-4O13559 YFR020WYFR020W 699 nt10.45□□□□□ -0.74
YRF1-4O13559 HEL2YDR266C 1920 nt10.44□□□□□ -0.74
YRF1-4O13559 MDM35YKL053C-A 261 nt10.43□□□□□ -0.74
YRF1-4O13559 FUS3YBL016W 1062 nt10.43□□□□□ -0.74
YRF1-4O13559 MFT1YML062C 1179 nt10.43□□□□□ -0.74
YRF1-4O13559 CYT1YOR065W 930 nt10.43□□□□□ -0.74
YRF1-4O13559 YDR467CYDR467C 327 nt10.42□□□□□ -0.74
YRF1-4O13559 YPT11YNL304W 1254 nt10.42□□□□□ -0.74
YRF1-4O13559 YER156CYER156C 1017 nt10.41□□□□□ -0.74
YRF1-4O13559 GAS1YMR307W 1680 nt10.41□□□□□ -0.74
YRF1-4O13559 PET494YNR045W 1470 nt10.4□□□□□ -0.75
YRF1-4O13559 CWP2YKL096W-A 279 nt10.39□□□□□ -0.75
YRF1-4O13559 SBP1YHL034C 885 nt10.39□□□□□ -0.75
YRF1-4O13559 YJL043WYJL043W 774 nt10.38□□□□□ -0.75
YRF1-4O13559 HXT10YFL011W 1641 nt10.36□□□□□ -0.75
YRF1-4O13559 RSM7YJR113C 744 nt10.35□□□□□ -0.75
YRF1-4O13559 DPL1YDR294C 1770 nt10.32□□□□□ -0.76
YRF1-4O13559 LEU4YNL104C 1860 nt10.32□□□□□ -0.76
YRF1-4O13559 RRT14YIL127C 621 nt10.31□□□□□ -0.76
YRF1-4O13559 NUP53YMR153W 1428 nt10.3□□□□□ -0.76
YRF1-4O13559 CAK1YFL029C 1107 nt10.3□□□□□ -0.76
YRF1-4O13559 THI3YDL080C 1830 nt10.29□□□□□ -0.76
YRF1-4O13559 COS10YNR075W 1125 nt10.29□□□□□ -0.76
YRF1-4O13559 RPS6AYPL090C 711 nt10.29□□□□□ -0.76
YRF1-4O13559 RPS6BYBR181C 711 nt10.29□□□□□ -0.76
YRF1-4O13559 TDH1YJL052W 999 nt10.27□□□□□ -0.76
YRF1-4O13559 INH1YDL181W 258 nt10.26□□□□□ -0.77
YRF1-4O13559 RPR1RPR1 369 nt10.26□□□□□ -0.77
YRF1-4O13559 BXI1YNL305C 894 nt10.26□□□□□ -0.77
YRF1-4O13559 GPM1YKL152C 744 nt10.26□□□□□ -0.77
YRF1-4O13559 OCH1YGL038C 1443 nt10.25□□□□□ -0.77
YRF1-4O13559 YMC2YBR104W 990 nt10.25□□□□□ -0.77
YRF1-4O13559 YLR460CYLR460C 1131 nt10.24□□□□□ -0.77
YRF1-4O13559 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt10.24□□□□□ -0.77
YRF1-4O13559 YPR084WYPR084W 1371 nt10.23□□□□□ -0.77
YRF1-4O13559 GGA2YHR108W 1758 nt10.23□□□□□ -0.77
YRF1-4O13559 YBL095WYBL095W 813 nt10.23□□□□□ -0.77
YRF1-4O13559 AGP3YFL055W 1677 nt10.22□□□□□ -0.77
YRF1-4O13559 KRR1YCL059C 951 nt10.21□□□□□ -0.78
YRF1-4O13559 MET22YOL064C 1074 nt10.21□□□□□ -0.78
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