Protein–RNA interactions for Protein: O00311

CDC7, Cell division cycle 7-related protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC7O00311 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC7O00311 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC7O00311 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC7O00311 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC7O00311 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC7O00311 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC7O00311 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC7O00311 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC7O00311 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC7O00311 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC7O00311 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC7O00311 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC7O00311 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC7O00311 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC7O00311 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC7O00311 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC7O00311 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC7O00311 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC7O00311 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC7O00311 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC7O00311 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC7O00311 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC7O00311 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC7O00311 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC7O00311 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC7O00311 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC7O00311 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC7O00311 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC7O00311 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC7O00311 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC7O00311 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC7O00311 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDC7O00311 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDC7O00311 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDC7O00311 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC7O00311 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC7O00311 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC7O00311 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC7O00311 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC7O00311 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC7O00311 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC7O00311 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC7O00311 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC7O00311 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC7O00311 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC7O00311 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC7O00311 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC7O00311 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC7O00311 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC7O00311 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC7O00311 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC7O00311 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC7O00311 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC7O00311 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC7O00311 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC7O00311 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC7O00311 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC7O00311 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC7O00311 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC7O00311 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC7O00311 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC7O00311 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC7O00311 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC7O00311 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC7O00311 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC7O00311 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC7O00311 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC7O00311 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC7O00311 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC7O00311 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC7O00311 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC7O00311 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC7O00311 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC7O00311 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC7O00311 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC7O00311 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC7O00311 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC7O00311 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC7O00311 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC7O00311 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC7O00311 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC7O00311 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC7O00311 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC7O00311 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC7O00311 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC7O00311 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC7O00311 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC7O00311 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC7O00311 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC7O00311 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC7O00311 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC7O00311 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC7O00311 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC7O00311 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC7O00311 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC7O00311 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC7O00311 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC7O00311 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC7O00311 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC7O00311 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms