Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QR89 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QR89 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QR89 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QR89 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QR89 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QR89 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QR89 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QR89 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QR89 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QR89 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QR89 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QR89 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QR89 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QR89 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QR89 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QR89 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QR89 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QR89 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QR89 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QR89 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QR89 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QR89 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QR89 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QR89 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QR89 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QR89 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QR89 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
J3QR89 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QR89 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QR89 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QR89 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QR89 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QR89 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
J3QR89 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QR89 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
J3QR89 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QR89 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QR89 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QR89 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QR89 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QR89 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
J3QR89 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QR89 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QR89 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QR89 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QR89 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QR89 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QR89 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QR89 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
J3QR89 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3QR89 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3QR89 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3QR89 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3QR89 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3QR89 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3QR89 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3QR89 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QR89 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QR89 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QR89 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QR89 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QR89 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QR89 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QR89 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QR89 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QR89 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QR89 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QR89 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QR89 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QR89 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QR89 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QR89 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QR89 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QR89 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
J3QR89 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
J3QR89 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
J3QR89 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
J3QR89 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3QR89 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3QR89 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3QR89 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3QR89 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3QR89 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3QR89 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3QR89 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3QR89 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3QR89 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3QR89 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3QR89 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
J3QR89 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
J3QR89 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
J3QR89 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
J3QR89 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
J3QR89 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
J3QR89 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
J3QR89 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
J3QR89 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
J3QR89 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
J3QR89 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms