Protein–RNA interactions for Protein: F8W8V4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8W8V4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
F8W8V4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
F8W8V4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
F8W8V4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
F8W8V4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
F8W8V4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
F8W8V4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
F8W8V4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
F8W8V4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
F8W8V4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
F8W8V4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
F8W8V4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
F8W8V4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
F8W8V4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
F8W8V4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
F8W8V4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
F8W8V4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
F8W8V4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
F8W8V4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
F8W8V4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
F8W8V4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
F8W8V4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
F8W8V4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
F8W8V4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
F8W8V4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
F8W8V4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
F8W8V4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
F8W8V4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
F8W8V4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
F8W8V4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
F8W8V4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
F8W8V4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
F8W8V4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
F8W8V4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
F8W8V4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
F8W8V4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
F8W8V4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
F8W8V4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
F8W8V4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
F8W8V4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
F8W8V4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
F8W8V4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
F8W8V4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
F8W8V4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
F8W8V4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
F8W8V4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
F8W8V4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
F8W8V4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
F8W8V4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
F8W8V4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
F8W8V4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
F8W8V4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
F8W8V4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
F8W8V4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
F8W8V4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
F8W8V4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
F8W8V4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
F8W8V4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
F8W8V4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
F8W8V4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
F8W8V4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
F8W8V4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
F8W8V4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
F8W8V4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
F8W8V4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
F8W8V4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
F8W8V4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
F8W8V4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
F8W8V4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
F8W8V4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
F8W8V4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
F8W8V4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
F8W8V4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
F8W8V4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
F8W8V4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
F8W8V4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
F8W8V4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
F8W8V4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
F8W8V4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
F8W8V4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
F8W8V4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
F8W8V4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
F8W8V4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
F8W8V4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
F8W8V4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
F8W8V4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
F8W8V4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
F8W8V4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
F8W8V4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
F8W8V4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
F8W8V4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
F8W8V4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
F8W8V4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
F8W8V4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
F8W8V4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
F8W8V4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
F8W8V4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
F8W8V4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
F8W8V4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
F8W8V4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms