Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBY3A6NI87 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBY3A6NI87 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBY3A6NI87 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBY3A6NI87 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBY3A6NI87 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBY3A6NI87 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBY3A6NI87 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBY3A6NI87 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBY3A6NI87 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBY3A6NI87 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBY3A6NI87 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBY3A6NI87 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CBY3A6NI87 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CBY3A6NI87 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CBY3A6NI87 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CBY3A6NI87 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CBY3A6NI87 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CBY3A6NI87 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CBY3A6NI87 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CBY3A6NI87 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CBY3A6NI87 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CBY3A6NI87 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CBY3A6NI87 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CBY3A6NI87 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CBY3A6NI87 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CBY3A6NI87 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBY3A6NI87 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBY3A6NI87 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBY3A6NI87 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBY3A6NI87 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBY3A6NI87 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBY3A6NI87 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBY3A6NI87 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBY3A6NI87 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CBY3A6NI87 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBY3A6NI87 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBY3A6NI87 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBY3A6NI87 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBY3A6NI87 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBY3A6NI87 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBY3A6NI87 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBY3A6NI87 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBY3A6NI87 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBY3A6NI87 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBY3A6NI87 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBY3A6NI87 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBY3A6NI87 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBY3A6NI87 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBY3A6NI87 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBY3A6NI87 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBY3A6NI87 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBY3A6NI87 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CBY3A6NI87 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBY3A6NI87 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBY3A6NI87 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBY3A6NI87 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBY3A6NI87 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBY3A6NI87 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBY3A6NI87 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBY3A6NI87 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBY3A6NI87 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBY3A6NI87 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms