Protein–RNA interactions for Protein: A5YKK6

CNOT1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT1A5YKK6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNOT1A5YKK6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNOT1A5YKK6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNOT1A5YKK6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNOT1A5YKK6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CNOT1A5YKK6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNOT1A5YKK6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNOT1A5YKK6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNOT1A5YKK6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNOT1A5YKK6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNOT1A5YKK6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNOT1A5YKK6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CNOT1A5YKK6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNOT1A5YKK6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CNOT1A5YKK6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNOT1A5YKK6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNOT1A5YKK6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNOT1A5YKK6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNOT1A5YKK6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNOT1A5YKK6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNOT1A5YKK6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CNOT1A5YKK6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNOT1A5YKK6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNOT1A5YKK6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNOT1A5YKK6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNOT1A5YKK6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNOT1A5YKK6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNOT1A5YKK6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNOT1A5YKK6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNOT1A5YKK6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNOT1A5YKK6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNOT1A5YKK6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNOT1A5YKK6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNOT1A5YKK6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNOT1A5YKK6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNOT1A5YKK6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNOT1A5YKK6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CNOT1A5YKK6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNOT1A5YKK6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CNOT1A5YKK6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNOT1A5YKK6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNOT1A5YKK6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CNOT1A5YKK6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNOT1A5YKK6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNOT1A5YKK6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNOT1A5YKK6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNOT1A5YKK6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNOT1A5YKK6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNOT1A5YKK6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNOT1A5YKK6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNOT1A5YKK6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNOT1A5YKK6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNOT1A5YKK6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNOT1A5YKK6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNOT1A5YKK6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNOT1A5YKK6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNOT1A5YKK6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNOT1A5YKK6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNOT1A5YKK6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNOT1A5YKK6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CNOT1A5YKK6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNOT1A5YKK6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CNOT1A5YKK6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNOT1A5YKK6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNOT1A5YKK6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNOT1A5YKK6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CNOT1A5YKK6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CNOT1A5YKK6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNOT1A5YKK6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNOT1A5YKK6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNOT1A5YKK6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNOT1A5YKK6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNOT1A5YKK6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT1A5YKK6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT1A5YKK6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNOT1A5YKK6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNOT1A5YKK6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNOT1A5YKK6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNOT1A5YKK6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT1A5YKK6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT1A5YKK6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNOT1A5YKK6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNOT1A5YKK6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNOT1A5YKK6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNOT1A5YKK6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNOT1A5YKK6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNOT1A5YKK6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNOT1A5YKK6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNOT1A5YKK6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNOT1A5YKK6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNOT1A5YKK6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNOT1A5YKK6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CNOT1A5YKK6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNOT1A5YKK6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNOT1A5YKK6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNOT1A5YKK6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNOT1A5YKK6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNOT1A5YKK6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CNOT1A5YKK6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CNOT1A5YKK6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms