Protein–RNA interactions for Protein: A2RRP1

NBAS, Neuroblastoma-amplified sequence, humanhuman

Predictions only

Length 2,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBASA2RRP1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBASA2RRP1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBASA2RRP1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBASA2RRP1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NBASA2RRP1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NBASA2RRP1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NBASA2RRP1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NBASA2RRP1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NBASA2RRP1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NBASA2RRP1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NBASA2RRP1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NBASA2RRP1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NBASA2RRP1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NBASA2RRP1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NBASA2RRP1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBASA2RRP1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBASA2RRP1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBASA2RRP1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBASA2RRP1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBASA2RRP1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBASA2RRP1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBASA2RRP1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBASA2RRP1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBASA2RRP1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBASA2RRP1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBASA2RRP1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBASA2RRP1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBASA2RRP1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NBASA2RRP1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBASA2RRP1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBASA2RRP1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBASA2RRP1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBASA2RRP1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NBASA2RRP1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBASA2RRP1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBASA2RRP1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBASA2RRP1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBASA2RRP1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBASA2RRP1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBASA2RRP1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBASA2RRP1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBASA2RRP1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBASA2RRP1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBASA2RRP1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBASA2RRP1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBASA2RRP1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBASA2RRP1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBASA2RRP1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBASA2RRP1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBASA2RRP1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NBASA2RRP1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBASA2RRP1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NBASA2RRP1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBASA2RRP1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBASA2RRP1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBASA2RRP1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBASA2RRP1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBASA2RRP1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBASA2RRP1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NBASA2RRP1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBASA2RRP1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBASA2RRP1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBASA2RRP1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBASA2RRP1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NBASA2RRP1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBASA2RRP1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBASA2RRP1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBASA2RRP1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBASA2RRP1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBASA2RRP1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBASA2RRP1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NBASA2RRP1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBASA2RRP1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NBASA2RRP1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBASA2RRP1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBASA2RRP1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NBASA2RRP1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NBASA2RRP1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBASA2RRP1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBASA2RRP1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NBASA2RRP1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBASA2RRP1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBASA2RRP1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBASA2RRP1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBASA2RRP1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBASA2RRP1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBASA2RRP1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBASA2RRP1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBASA2RRP1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBASA2RRP1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBASA2RRP1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBASA2RRP1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBASA2RRP1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBASA2RRP1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBASA2RRP1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NBASA2RRP1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBASA2RRP1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBASA2RRP1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBASA2RRP1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBASA2RRP1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms